23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2531 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2531  hypothetical protein  100 
 
 		 743 aa  1526    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2886  hypothetical protein  34.36 
 
 		 741 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0221  hypothetical protein  34.36 
 
 		 741 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  35.55 
 
 		 754 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  26.58 
 
 		 644 aa  64.3  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  27.44 
 
 		 620 aa  62  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  35.88 
 
 		 600 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  26.19 
 
 		 635 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  28.44 
 
 		 672 aa  54.3  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  25.37 
 
 		 619 aa  53.5  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3759  hypothetical protein  25.85 
 
 		 558 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  22.44 
 
 		 618 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  25.48 
 
 		 580 aa  51.2  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  25.96 
 
 		 615 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  29.41 
 
 		 641 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  24.64 
 
 		 625 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  23.3 
 
 		 670 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  24.15 
 
 		 620 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  24.88 
 
 		 623 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  24.88 
 
 		 616 aa  47.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  27.74 
 
 		 671 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  27.74 
 
 		 689 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  29.41 
 
 		 631 aa  43.9  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>