30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  68.42 
 
 		 670 aa  919    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  100 
 
 		 672 aa  1382    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  48.01 
 
 		 689 aa  598  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  47.85 
 
 		 671 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  40.68 
 
 		 632 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  40.94 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  42.21 
 
 		 642 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  40.18 
 
 		 637 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  39.51 
 
 		 619 aa  399  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  38.52 
 
 		 616 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  38.75 
 
 		 623 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  36.76 
 
 		 615 aa  360  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  66.79 
 
 		 276 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  35.25 
 
 		 625 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  29.27 
 
 		 607 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  28.13 
 
 		 618 aa  233  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  26.8 
 
 		 564 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  29.06 
 
 		 620 aa  219  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  27.33 
 
 		 631 aa  211  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  28.09 
 
 		 580 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  29.16 
 
 		 641 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  28.63 
 
 		 635 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  26.98 
 
 		 607 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  27.57 
 
 		 600 aa  135  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  29.27 
 
 		 754 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  28.36 
 
 		 644 aa  67.8  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0221  hypothetical protein  27.69 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2886  hypothetical protein  27.69 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  29.36 
 
 		 620 aa  57.4  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2531  hypothetical protein  28.44 
 
 		 743 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>