27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2520 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  63.41 
 
 
637 aa  804    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  64.74 
 
 
642 aa  782    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  100 
 
 
632 aa  1294    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  55.68 
 
 
629 aa  666    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  42.77 
 
 
625 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  41.11 
 
 
671 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  41.11 
 
 
689 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  41.61 
 
 
619 aa  435  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  39.78 
 
 
670 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  42.37 
 
 
615 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  41.16 
 
 
616 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  40.19 
 
 
672 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  40.6 
 
 
623 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  34.81 
 
 
607 aa  293  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  33.7 
 
 
618 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  31.59 
 
 
580 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  32.97 
 
 
620 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  28.41 
 
 
564 aa  243  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  30.5 
 
 
631 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  28.42 
 
 
641 aa  212  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  47.15 
 
 
276 aa  208  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  29.32 
 
 
635 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  27.79 
 
 
607 aa  189  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  28.28 
 
 
600 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  25 
 
 
644 aa  64.3  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  26.25 
 
 
620 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  24.27 
 
 
754 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.717395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>