30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1965 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  100 
 
 
600 aa  1208    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  28.64 
 
 
641 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  28.33 
 
 
635 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  29.51 
 
 
580 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  27.8 
 
 
607 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  31.72 
 
 
615 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  25.61 
 
 
564 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  27.69 
 
 
631 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  30.46 
 
 
616 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  31.59 
 
 
623 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  26.84 
 
 
620 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  30.43 
 
 
619 aa  162  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  29.14 
 
 
618 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  27.8 
 
 
625 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  29.63 
 
 
637 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  28.28 
 
 
632 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  30.04 
 
 
642 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  27.03 
 
 
672 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  28.01 
 
 
607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  24.88 
 
 
671 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  24.88 
 
 
689 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  38.72 
 
 
629 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  27.8 
 
 
670 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  29.93 
 
 
276 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  33.96 
 
 
754 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  33.06 
 
 
644 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2886  hypothetical protein  33.11 
 
 
741 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0221  hypothetical protein  33.11 
 
 
741 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2531  hypothetical protein  35.88 
 
 
743 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  27.38 
 
 
620 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>