29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4883 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  66.79 
 
 		 672 aa  358  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  66.54 
 
 		 670 aa  353  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  61.26 
 
 		 689 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  61.26 
 
 		 671 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  48.15 
 
 		 629 aa  219  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  47.15 
 
 		 632 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  43.6 
 
 		 637 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  45.14 
 
 		 642 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  43.51 
 
 		 619 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  42.34 
 
 		 615 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  43.53 
 
 		 623 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  41.15 
 
 		 616 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  38.7 
 
 		 625 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  36.11 
 
 		 618 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  34.72 
 
 		 564 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  35.45 
 
 		 631 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  36.08 
 
 		 635 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  36.02 
 
 		 620 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  34.81 
 
 		 607 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  35.88 
 
 		 607 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  34.62 
 
 		 641 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  33.59 
 
 		 580 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  29.93 
 
 		 600 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  26.35 
 
 		 620 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  25.6 
 
 		 644 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  23.08 
 
 		 754 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0221  hypothetical protein  25 
 
 		 741 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2886  hypothetical protein  25 
 
 		 741 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>