30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0830 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  99.85 
 
 
671 aa  1373    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  100 
 
 
689 aa  1409    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  49.47 
 
 
670 aa  627  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  47.35 
 
 
672 aa  592  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  41.59 
 
 
642 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  41.11 
 
 
632 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  40.06 
 
 
629 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  39.37 
 
 
637 aa  425  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  39.12 
 
 
619 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  38.95 
 
 
616 aa  415  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  38.59 
 
 
615 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  38.87 
 
 
623 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  36.36 
 
 
625 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  61.26 
 
 
276 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  29.83 
 
 
607 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  30.46 
 
 
620 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  29.43 
 
 
618 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  28.08 
 
 
564 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  28.95 
 
 
580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  27.13 
 
 
641 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  28.45 
 
 
631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  30.75 
 
 
635 aa  181  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  26.92 
 
 
607 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  24.88 
 
 
600 aa  132  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  26.37 
 
 
644 aa  58.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  28.05 
 
 
620 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  25.51 
 
 
754 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2531  hypothetical protein  27.74 
 
 
743 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0221  hypothetical protein  23.08 
 
 
741 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2886  hypothetical protein  23.08 
 
 
741 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>