25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2729 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  100 
 
 
637 aa  1304    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  60.97 
 
 
642 aa  730    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  63.41 
 
 
632 aa  804    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  53.96 
 
 
629 aa  654    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  39.37 
 
 
671 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  39.37 
 
 
689 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  39.94 
 
 
625 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  40.48 
 
 
615 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  39.84 
 
 
619 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  40.18 
 
 
672 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  38.88 
 
 
623 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  39.19 
 
 
670 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  38.24 
 
 
616 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  32.66 
 
 
607 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  32.97 
 
 
618 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  32.29 
 
 
620 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  32.17 
 
 
580 aa  254  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  28.03 
 
 
564 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  29.88 
 
 
631 aa  223  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  29.12 
 
 
641 aa  208  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  43.6 
 
 
276 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  28.87 
 
 
635 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  30.17 
 
 
607 aa  176  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  29.63 
 
 
600 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  24.29 
 
 
644 aa  52  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>