27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0467 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  54.11 
 
 		 637 aa  674    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  60.25 
 
 		 642 aa  707    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  55.68 
 
 		 632 aa  689    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1283    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  40.78 
 
 		 671 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  40.78 
 
 		 689 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  41.69 
 
 		 615 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  40.98 
 
 		 625 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  41.6 
 
 		 672 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  40.41 
 
 		 619 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  41.8 
 
 		 616 aa  438  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  40.4 
 
 		 670 aa  428  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  40.86 
 
 		 623 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  30.76 
 
 		 618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  32.44 
 
 		 607 aa  251  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  30.48 
 
 		 620 aa  246  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  28.21 
 
 		 564 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  29.24 
 
 		 631 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  49.59 
 
 		 276 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  29.74 
 
 		 580 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  27.8 
 
 		 641 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  27.6 
 
 		 635 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  29.02 
 
 		 607 aa  173  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  29.42 
 
 		 600 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  22.76 
 
 		 644 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  27.54 
 
 		 620 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  26.8 
 
 		 754 aa  47.4  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.717395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>