26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2675 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  60.97 
 
 		 637 aa  746    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  100 
 
 		 642 aa  1293    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  64.74 
 
 		 632 aa  803    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  60.1 
 
 		 629 aa  698    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  42.13 
 
 		 625 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  41.59 
 
 		 671 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  41.63 
 
 		 689 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  41.5 
 
 		 619 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  42.15 
 
 		 672 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  41.18 
 
 		 615 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  40.4 
 
 		 616 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  41.31 
 
 		 623 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  41.22 
 
 		 670 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  32.45 
 
 		 607 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  32.04 
 
 		 620 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  33.49 
 
 		 618 aa  267  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  30.82 
 
 		 631 aa  238  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  28.06 
 
 		 564 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  31.35 
 
 		 580 aa  232  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  30.49 
 
 		 635 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  46.51 
 
 		 276 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  28.7 
 
 		 641 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  29.83 
 
 		 607 aa  194  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  30.45 
 
 		 600 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  24.4 
 
 		 644 aa  50.4  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  31.4 
 
 		 620 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>