30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2204 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  86.5 
 
 		 623 aa  1110    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  88.65 
 
 		 616 aa  1134    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  100 
 
 		 619 aa  1277    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  69.72 
 
 		 615 aa  900    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  45.97 
 
 		 625 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  41.61 
 
 		 632 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2675  hypothetical protein  41.22 
 
 		 642 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  normal  0.830028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  40.51 
 
 		 629 aa  422  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  39.12 
 
 		 671 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  39.12 
 
 		 689 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2729  Protein of unknown function DUF1998  39.84 
 
 		 637 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0213066  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  39.48 
 
 		 670 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  39.63 
 
 		 672 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  38.58 
 
 		 607 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  35.94 
 
 		 618 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  34.63 
 
 		 620 aa  330  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  32.93 
 
 		 631 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  30.84 
 
 		 564 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  30.69 
 
 		 641 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  30.55 
 
 		 580 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  29.41 
 
 		 635 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  43.51 
 
 		 276 aa  196  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  30.43 
 
 		 600 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  40.93 
 
 		 607 aa  158  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  27.57 
 
 		 644 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  28.45 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2531  hypothetical protein  25.37 
 
 		 743 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  28.12 
 
 		 754 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2886  hypothetical protein  29.23 
 
 		 741 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0221  hypothetical protein  29.23 
 
 		 741 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>