29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4913 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2886  hypothetical protein  51.66 
 
 		 741 aa  740    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0221  hypothetical protein  51.66 
 
 		 741 aa  740    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4913  hypothetical protein  100 
 
 		 754 aa  1566    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.717395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2531  hypothetical protein  35.35 
 
 		 743 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1185  hypothetical protein  30.8 
 
 		 620 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03290  protein of unknown function (DUF1998)  29.27 
 
 		 672 aa  72.8  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.328267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3759  hypothetical protein  29.8 
 
 		 558 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1965  hypothetical protein  33.96 
 
 		 600 aa  65.1  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1513  hypothetical protein  27.23 
 
 		 644 aa  64.7  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2321  hypothetical protein  26.52 
 
 		 670 aa  63.9  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1414  hypothetical protein  23.4 
 
 		 635 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.751041  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2654  hypothetical protein  29.89 
 
 		 641 aa  58.9  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0351  Protein of unknown function DUF1998  28.3 
 
 		 580 aa  55.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1185  hypothetical protein  30.53 
 
 		 616 aa  53.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3851  hypothetical protein  28.68 
 
 		 615 aa  51.2  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0830  hypothetical protein  25.51 
 
 		 689 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0814  hypothetical protein  25.51 
 
 		 671 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4100  hypothetical protein  30.3 
 
 		 631 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0227  hypothetical protein  26.36 
 
 		 618 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2032  hypothetical protein  28.49 
 
 		 564 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1274  hypothetical protein  27.56 
 
 		 607 aa  48.9  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3674  hypothetical protein  26.95 
 
 		 623 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2204  hypothetical protein  28.12 
 
 		 619 aa  48.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1057  hypothetical protein  27.97 
 
 		 607 aa  47.8  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0467  hypothetical protein  26.8 
 
 		 629 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4883  hypothetical protein  23.08 
 
 		 276 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2520  hypothetical protein  24.27 
 
 		 632 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1329  hypothetical protein  24.81 
 
 		 620 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5349  hypothetical protein  23.26 
 
 		 625 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184481  normal  0.236845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>