37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0998 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  574  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  42.22 
 
 		 280 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  38.85 
 
 		 285 aa  188  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0099  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  30.85 
 
 		 374 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  29.18 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0176  lipoprotein  32.08 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.185356 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  25.86 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  27.5 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  29.34 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  29.22 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  30.67 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  27.49 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  30.17 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  25.15 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  26.44 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  31.68 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  27.27 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  27.49 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  30.77 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  30.63 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  26.55 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  28.48 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  37.66 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  30.17 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  22.84 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  23.08 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  23.49 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  21.98 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  23.17 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  23.78 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  22.65 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  23.56 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  22.1 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  22.1 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  22.99 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>