37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2199 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  100 
 
 
288 aa  579  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  30.5 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  30.63 
 
 
287 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  30.66 
 
 
286 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  35.82 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  30.15 
 
 
289 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  29.2 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  33.71 
 
 
288 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  28.1 
 
 
286 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  27.37 
 
 
286 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  27.74 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  29.25 
 
 
289 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  26.86 
 
 
281 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  27.41 
 
 
278 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  28.11 
 
 
282 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  28.77 
 
 
295 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  27.44 
 
 
280 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  25.66 
 
 
290 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  25.38 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  25.38 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  25.46 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  25.18 
 
 
290 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  25.18 
 
 
290 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  28.78 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  24.82 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  25.45 
 
 
293 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  22.73 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  26.01 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  29.38 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  26.91 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  21.4 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  29.81 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  29.32 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  21.26 
 
 
359 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  24.43 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0099  putative lipoprotein  24.05 
 
 
292 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0176  lipoprotein  20.86 
 
 
299 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.185356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>