35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3789 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  100 
 
 		 287 aa  587  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  93.03 
 
 		 287 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  58.6 
 
 		 289 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  52.84 
 
 		 289 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  51.42 
 
 		 286 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  50.35 
 
 		 286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  46.81 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  39.02 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  33.46 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  30.63 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  31.8 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  24.54 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  25.62 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  24.64 
 
 		 282 aa  99  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  23.91 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  23.84 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  24 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  24.73 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  21.94 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  22.65 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  21.05 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  21.72 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  21.62 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  23.79 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  19.49 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  26.78 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  19.86 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  19.49 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  19.49 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  21.24 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  25.09 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  23.02 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  24.53 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  24.06 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  23.49 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>