27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0670 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  42.26 
 
 		 289 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  37.82 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0099  putative lipoprotein  31.09 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  29.26 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  26.01 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  26.01 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0176  lipoprotein  25.94 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.185356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  24.2 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  23.75 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  23.32 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  26.42 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  27.17 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  25.47 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  28.33 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  23.49 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  26.67 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  24.07 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  28.03 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  24.23 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  24.39 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  22.49 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  23.65 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  24.81 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  26.47 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  27.93 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  30.88 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>