37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2384 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  38.43 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  31.84 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  31.09 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  30.6 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  30.6 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  29.39 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  29.39 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  29.39 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  29.14 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  29.02 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  29.14 
 
 		 282 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  27.74 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  28.93 
 
 		 295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  29.96 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  27.34 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  29.18 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  26.33 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  25.81 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  27.44 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  25.37 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  23.66 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  28.35 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  25.09 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  22.14 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  22.14 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  28.19 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  21.13 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  23.05 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  22.15 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0099  putative lipoprotein  24.19 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  23.32 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  21.33 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0176  lipoprotein  25 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.185356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>