35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2306 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  98.97 
 
 		 290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  97.93 
 
 		 290 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  88.28 
 
 		 290 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  80.62 
 
 		 290 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  80.28 
 
 		 290 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  80.62 
 
 		 290 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  79.93 
 
 		 285 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  75.78 
 
 		 293 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  56.68 
 
 		 283 aa  316  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  53.93 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  48.19 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  31.18 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  29.68 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  29.08 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  25.81 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  27.07 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  26.2 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  24.82 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  24.8 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  27.31 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  23.66 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  24.06 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  22.94 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  26.32 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  24.55 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  22.14 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  21.86 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  23.95 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  24.63 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  24.29 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  23.26 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  23.31 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0099  putative lipoprotein  22.03 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  21.02 
 
 		 359 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>