36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0585 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  564  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  44.6 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  34.66 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  32.39 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  36.47 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  34.3 
 
 		 289 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  35.34 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  34.63 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  34.51 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  32.2 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  26.52 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  28.36 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  28.72 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  27.37 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  28.1 
 
 		 290 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  28.83 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  28.37 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  28.11 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  29.18 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  25.89 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  28.46 
 
 		 256 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  28.68 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  26.97 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  26.82 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  26.32 
 
 		 290 aa  95.5  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  26.32 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  25.94 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  22.5 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  23.94 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  30.06 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  28.28 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  28.82 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  26.06 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  26.58 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0176  lipoprotein  26.28 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.185356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>