37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0577 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  567  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  44.91 
 
 
288 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  35.71 
 
 
286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  35.71 
 
 
289 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  35.59 
 
 
286 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  31.8 
 
 
287 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  35.23 
 
 
286 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  31.79 
 
 
287 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  32.71 
 
 
289 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  29.12 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  28.93 
 
 
280 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  33.97 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  28.98 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  29.04 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  29.08 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  28.77 
 
 
288 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  27.99 
 
 
283 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  26.64 
 
 
281 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  26.44 
 
 
285 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  27.12 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  25.86 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  25.86 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  25.09 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  26.56 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  25.38 
 
 
286 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  22.43 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  25.68 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  25.78 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  31.72 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  23.62 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  24.14 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  30.82 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0099  putative lipoprotein  31.18 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  24.29 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  25 
 
 
374 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  22.26 
 
 
280 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0176  lipoprotein  24.84 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.185356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>