34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0228 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  772    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  53.2 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0176  lipoprotein  51.88 
 
 		 299 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.185356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  32.86 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  30.19 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  29.26 
 
 		 280 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0099  putative lipoprotein  26.47 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  24.11 
 
 		 289 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  23.79 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  25.18 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  22.15 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  22.06 
 
 		 287 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  23.72 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  23.62 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  24.26 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  25.15 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  24.91 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  23.69 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  24.43 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  28.12 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  23.38 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  20.07 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  23.02 
 
 		 283 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  23.1 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  26.87 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  23.58 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  24.72 
 
 		 282 aa  47  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  26.09 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  25.4 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  25.29 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  25.29 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  27.54 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  23.13 
 
 		 293 aa  43.5  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>