20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0099 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0099  putative lipoprotein  100 
 
 		 292 aa  577  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  40.07 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  32.71 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  31.02 
 
 		 280 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0176  lipoprotein  31.6 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.185356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  26.09 
 
 		 359 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  26.62 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  30.04 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  24.12 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  22.88 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  28.73 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  21.17 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  22.18 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  21.32 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  23.86 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  25.54 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  21.25 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  21.97 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>