137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004176 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  100 
 
 
248 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  87.1 
 
 
248 aa  428  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  55.51 
 
 
255 aa  280  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  45.05 
 
 
248 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.91 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.88 
 
 
236 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.65 
 
 
235 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.76 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.76 
 
 
235 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1318  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.97 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.76 
 
 
235 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1256  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.65 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.76 
 
 
235 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1326  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.65 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.57 
 
 
244 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02933  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.19 
 
 
216 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.61 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2600  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.99 
 
 
235 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  28.02 
 
 
243 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.7 
 
 
259 aa  111  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.14 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.61 
 
 
233 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.61 
 
 
233 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  25.87 
 
 
230 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.07 
 
 
235 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  29.22 
 
 
235 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.8 
 
 
235 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  29.44 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  29.17 
 
 
262 aa  92.4  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  27.65 
 
 
265 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1158  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.47 
 
 
235 aa  85.9  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.623618  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.43 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.98 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.42 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.5 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1953  flageller protein FlgA  26.85 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1067  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  29.73 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0500277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  24.34 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1318  flageller protein FlgA  26.2 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.69 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.81 
 
 
250 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.19 
 
 
214 aa  72  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.19 
 
 
214 aa  72  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.81 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.54 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  26.55 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  26.95 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.27 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  29.41 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1477  flageller protein FlgA  23.26 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1979  flageller protein FlgA  26.75 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.09 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.54 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  27.19 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  25.54 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.49 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26 
 
 
218 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.27 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2560  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443953 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.12 
 
 
326 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  26.67 
 
 
254 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  35.07 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3652  flageller protein FlgA  28.67 
 
 
222 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3972  SAF domain-containing protein  27.48 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.58 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  24.18 
 
 
245 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.08 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.08 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.22 
 
 
366 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.7 
 
 
358 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3074  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  26.73 
 
 
239 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.72 
 
 
360 aa  58.9  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0570  SAF domain-containing protein  24.46 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.06 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3795  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.91 
 
 
504 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.41 
 
 
355 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  32.48 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  28.91 
 
 
502 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1382  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.93 
 
 
373 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  30.43 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1505  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.58 
 
 
370 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3244  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.16 
 
 
348 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3270  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.16 
 
 
348 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132076  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1430  flagellar basal body P-ring formation protein FlgA  28.57 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.4 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.75 
 
 
347 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2947  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.81 
 
 
424 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  28.85 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.01 
 
 
380 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3558  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  26.44 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0461  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.81 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4419  SAF domain-containing protein  23.78 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.85 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3046  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.37 
 
 
348 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4711  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.95 
 
 
343 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0269631  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0239  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.62 
 
 
538 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  26.81 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1997  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.48 
 
 
254 aa  49.3  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.54 
 
 
320 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2101  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.09 
 
 
254 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>