114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1342 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  62.98 
 
 
235 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  62.13 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  60 
 
 
257 aa  297  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1318  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  57.45 
 
 
235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1326  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  57.87 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1256  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  57.45 
 
 
235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2600  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  55.74 
 
 
235 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  56.17 
 
 
235 aa  280  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  54.04 
 
 
235 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  54.04 
 
 
235 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  53.62 
 
 
235 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  54.04 
 
 
235 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  54.89 
 
 
235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  53.62 
 
 
235 aa  248  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1158  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  54.04 
 
 
235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.623618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  33.62 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.64 
 
 
236 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.69 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  25.78 
 
 
248 aa  98.6  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02933  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.16 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.67 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.44 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  30.69 
 
 
243 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  30.61 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.31 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.72 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.29 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  30 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  28.73 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.18 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  25.96 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  29.32 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  29.8 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.87 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3972  SAF domain-containing protein  32.67 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.8 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.5 
 
 
250 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.34 
 
 
250 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.04 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.54 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.04 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.37 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.37 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.5 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.72 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.08 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.63 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.76 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.76 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  33.58 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3733  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.64 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  26.78 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  33.77 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1067  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  26.98 
 
 
230 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0500277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.62 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.46 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  26.17 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.58 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3652  flageller protein FlgA  26.85 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.58 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.53 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  29.82 
 
 
281 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  27.4 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2519  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.57 
 
 
346 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3558  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  24.85 
 
 
234 aa  51.6  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3071  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.95 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3715  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.12 
 
 
291 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2936  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.95 
 
 
418 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4792  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.12 
 
 
291 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.245813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.32 
 
 
320 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1477  flageller protein FlgA  25.15 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1979  flageller protein FlgA  26.87 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  30.16 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3021  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.49 
 
 
388 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2735  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  23.23 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000036483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3157  FlgA family protein  28.87 
 
 
343 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2947  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  23.53 
 
 
424 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2412  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25 
 
 
310 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3026  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25 
 
 
310 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.124973  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  27.23 
 
 
236 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0600  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  26.56 
 
 
162 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0036  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  36.59 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0393  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.91 
 
 
416 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1667  SAF domain-containing protein  36.59 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0285706  normal  0.0223533 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3045  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.17 
 
 
408 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.279341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3677  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.27 
 
 
176 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3795  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  21.97 
 
 
504 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1318  flageller protein FlgA  24.26 
 
 
248 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1621  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  31.4 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.99379  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  25.15 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  21.97 
 
 
502 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.03 
 
 
355 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0633  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25 
 
 
164 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683972  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0622  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  25 
 
 
164 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1204  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.96 
 
 
286 aa  45.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1251  SAF domain-containing protein  26.96 
 
 
280 aa  45.4  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.792381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  29.46 
 
 
324 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0028  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.48 
 
 
148 aa  45.1  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.01 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>