85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2844 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 		 360 aa  700    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.14 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2560  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.62 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.91 
 
 		 347 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4424  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.51 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1382  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.16 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.19 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.97 
 
 		 366 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1505  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.36 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.37 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.41 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4711  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.85 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0269631  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3475  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.74 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  0.226708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3244  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.8 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0824  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.07 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3270  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.07 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3046  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.07 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4192  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.54 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  34.78 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1430  flagellar basal body P-ring formation protein FlgA  33.33 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.34 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.53 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1997  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.21 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2986  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.53 
 
 		 139 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2426  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.21 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23990  Flagellar protein FlgA  34.31 
 
 		 231 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.59 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  31.06 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  23.16 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2704  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  23.7 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  29.41 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2606  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.56 
 
 		 139 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.690909  hitchhiker  0.000478924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  29.13 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2116  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.43 
 
 		 138 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  28.57 
 
 		 248 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3972  SAF domain-containing protein  23.58 
 
 		 245 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.89 
 
 		 244 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.74 
 
 		 242 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.53 
 
 		 141 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2959  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30 
 
 		 138 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.569087  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.68 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.93 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.58 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.65 
 
 		 225 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.58 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.58 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  30.58 
 
 		 243 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2971  SAF domain-containing protein  29.84 
 
 		 217 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3652  flageller protein FlgA  27.78 
 
 		 222 aa  49.7  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.57 
 
 		 237 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2947  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.4 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  32.38 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  31.45 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  27.35 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  20.11 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  30.47 
 
 		 238 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3826  SAF domain-containing protein  31.25 
 
 		 250 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.294228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3099  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.25 
 
 		 250 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  27.1 
 
 		 240 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02933  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25 
 
 		 216 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.2 
 
 		 250 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1270  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.05 
 
 		 219 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0241853 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  26.44 
 
 		 324 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.35 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1095  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.95 
 
 		 268 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.7 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.96 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1268  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286326  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1552  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.12 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0622  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  34.41 
 
 		 164 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  28.18 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0633  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.41 
 
 		 164 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683972  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3795  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.11 
 
 		 504 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0600  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  33.33 
 
 		 162 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1953  flageller protein FlgA  31.52 
 
 		 235 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0570  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.06 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.12 
 
 		 249 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  33.67 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2199  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.06 
 
 		 219 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1241  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.06 
 
 		 219 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.684745  normal  0.229528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.83 
 
 		 235 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1285  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.23 
 
 		 219 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115713  normal  0.0340077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.36 
 
 		 214 aa  42.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.36 
 
 		 214 aa  42.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>