94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1682 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 		 366 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  82.57 
 
 		 358 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4424  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  68.82 
 
 		 342 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1505  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  61.51 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1382  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  59.46 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  55.49 
 
 		 380 aa  346  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  57.14 
 
 		 355 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.83 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4711  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.33 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0269631  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3244  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.66 
 
 		 348 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0824  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.14 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3046  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.66 
 
 		 348 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3270  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.1 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.97 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.87 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2560  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.87 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443953 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.09 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  37.23 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  34.81 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  35.12 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  39.34 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  35.51 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  39.06 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  38.17 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  32.91 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.58 
 
 		 252 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  33.08 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2606  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.89 
 
 		 139 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.690909  hitchhiker  0.000478924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4192  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  40.24 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3475  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.73 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  0.226708 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.03 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.71 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  30.22 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1477  flageller protein FlgA  33.33 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.03 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.03 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.79 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.79 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.03 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.61 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  30.97 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.61 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  32.14 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1140  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.84 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2959  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.56 
 
 		 138 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.569087  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.8 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2986  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.8 
 
 		 139 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.67 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.61 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3450  SAF domain-containing protein  32.96 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.59 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.16 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26 
 
 		 252 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  25.33 
 
 		 248 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  29.33 
 
 		 235 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0139  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.09 
 
 		 160 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.126341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  32.82 
 
 		 254 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.09 
 
 		 160 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  32.5 
 
 		 248 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.12 
 
 		 141 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.91 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.49 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  29.68 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4208  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.09 
 
 		 160 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3157  FlgA family protein  32.45 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182361  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2116  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.14 
 
 		 138 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2519  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.92 
 
 		 346 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1430  flagellar basal body P-ring formation protein FlgA  32.94 
 
 		 247 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3677  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.33 
 
 		 176 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2704  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.16 
 
 		 423 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1667  SAF domain-containing protein  37.39 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0285706  normal  0.0223533 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0036  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  37.39 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0028  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.18 
 
 		 148 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  27.97 
 
 		 245 aa  47  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23990  Flagellar protein FlgA  27.5 
 
 		 231 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.75 
 
 		 232 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0741  flagellar protein FLGA precursor  32.53 
 
 		 159 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.97 
 
 		 232 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1251  SAF domain-containing protein  29.17 
 
 		 280 aa  46.2  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.792381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1204  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.17 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0393  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.25 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1621  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  33.91 
 
 		 225 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.99379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0183  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.87 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3558  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  32.1 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26 
 
 		 232 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.41 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.7 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3099  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.95 
 
 		 250 aa  43.5  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3826  SAF domain-containing protein  30.95 
 
 		 250 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.294228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.92 
 
 		 235 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1688  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  33.33 
 
 		 142 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163534  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3972  SAF domain-containing protein  24.58 
 
 		 245 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1098  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.07 
 
 		 161 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.368798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>