116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1594 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  77.87 
 
 
259 aa  377  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  65.2 
 
 
257 aa  323  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  62.98 
 
 
235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  60.79 
 
 
235 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1318  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  59.75 
 
 
235 aa  285  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1256  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  59.32 
 
 
235 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1326  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  59.32 
 
 
235 aa  279  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2600  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  54.43 
 
 
235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  54.04 
 
 
235 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  54.47 
 
 
235 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  53.62 
 
 
235 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  53.19 
 
 
235 aa  262  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1158  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  55.32 
 
 
235 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.623618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  53.62 
 
 
235 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  55.7 
 
 
235 aa  251  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.67 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  32.76 
 
 
230 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.07 
 
 
255 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  27.71 
 
 
248 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.31 
 
 
248 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02933  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.81 
 
 
216 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.52 
 
 
248 aa  101  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  30.33 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  31.94 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.46 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.8 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.8 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  25.79 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.85 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.84 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.12 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.58 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.12 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.16 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.85 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.71 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  28.21 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  25.86 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.73 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.73 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.73 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  28.22 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  26.23 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  33.58 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  29.71 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.27 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.71 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1067  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  28.87 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0500277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3972  SAF domain-containing protein  30.67 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  23.98 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2947  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.38 
 
 
424 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  28.67 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  27.95 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3558  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  26.47 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  27.54 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3157  FlgA family protein  31.71 
 
 
343 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.5 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  29.17 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.33 
 
 
245 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1477  flageller protein FlgA  23.04 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.3 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594164  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  26.47 
 
 
502 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  29.37 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.67 
 
 
347 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3795  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.47 
 
 
504 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  26.64 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.58 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1621  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  30.97 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.99379  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1667  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0285706  normal  0.0223533 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1204  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.83 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.34 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0036  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  33.33 
 
 
222 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1251  SAF domain-containing protein  27.83 
 
 
280 aa  52  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.792381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.49 
 
 
320 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3071  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.15 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0259  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.17 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3021  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.67 
 
 
388 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.12 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2936  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.15 
 
 
418 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3323  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.27 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2992  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.27 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2101  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.27 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.06 
 
 
246 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0239  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.24 
 
 
538 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0741  flagellar protein FLGA precursor  28.93 
 
 
159 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2412  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.84 
 
 
310 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3026  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.84 
 
 
310 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.124973  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3099  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  28.33 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.03 
 
 
355 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.67 
 
 
249 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2519  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.03 
 
 
346 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0265  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.48 
 
 
509 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3045  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.17 
 
 
408 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.279341 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1146  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.81 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000705954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0461  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.84 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  28.95 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  28.26 
 
 
281 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4711  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.51 
 
 
343 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0269631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0277  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.72 
 
 
507 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>