184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2683 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  100 
 
 
235 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  43.2 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  40.86 
 
 
250 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  39.65 
 
 
238 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  38.54 
 
 
252 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  39.78 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  39.25 
 
 
225 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  39.25 
 
 
250 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.98 
 
 
232 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.42 
 
 
232 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.02 
 
 
232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.23 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  36.17 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.94 
 
 
233 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.05 
 
 
244 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.94 
 
 
233 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 
262 aa  122  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1953  flageller protein FlgA  31.73 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3071  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.84 
 
 
315 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33 
 
 
242 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1318  flageller protein FlgA  33.5 
 
 
248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  29.26 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2936  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.84 
 
 
418 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.89 
 
 
320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3021  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.89 
 
 
388 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2947  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.12 
 
 
424 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2412  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.41 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3026  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.41 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.124973  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3045  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.89 
 
 
408 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.279341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.85 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.85 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  30.6 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.8 
 
 
257 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.04 
 
 
218 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3795  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.67 
 
 
504 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  32.06 
 
 
502 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.84 
 
 
225 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3323  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.6 
 
 
254 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0461  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.6 
 
 
254 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.77 
 
 
255 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2992  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.6 
 
 
254 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3074  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  36.27 
 
 
239 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2101  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.6 
 
 
254 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.55 
 
 
249 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1979  flageller protein FlgA  32.02 
 
 
251 aa  101  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4419  SAF domain-containing protein  34.57 
 
 
259 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0634  SAF domain-containing protein  30.94 
 
 
254 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0265  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.6 
 
 
509 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0277  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.6 
 
 
507 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.36 
 
 
237 aa  99  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594164  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3099  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.61 
 
 
250 aa  99  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3826  SAF domain-containing protein  31.61 
 
 
250 aa  99  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.294228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.19 
 
 
248 aa  99  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0239  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.65 
 
 
538 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.94 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.91 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  28.63 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.85 
 
 
235 aa  95.1  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3733  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.93 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1318  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.5 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212104 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  30.38 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.45 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3713  flageller protein FlgA  31.55 
 
 
246 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.35 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.83 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.83 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0570  SAF domain-containing protein  32.97 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.72 
 
 
248 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.42 
 
 
235 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.42 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2600  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.83 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.04 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2735  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.94 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000036483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  30.77 
 
 
281 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1256  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.07 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4792  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.52 
 
 
291 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.245813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.99 
 
 
252 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3715  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.52 
 
 
291 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300126 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1326  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.64 
 
 
235 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.77 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.21 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.45 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.45 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.45 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.9 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.277542  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  24.88 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  30.81 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1997  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.18 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.18 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2426  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.18 
 
 
269 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.75 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1552  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.36 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.73 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1524  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.89 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1586  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.4 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.73 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2971  SAF domain-containing protein  27.86 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272825  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  29.15 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  40.35 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1158  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.62 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.623618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>