136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0432 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  100 
 
 
236 aa  461  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  61.86 
 
 
248 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  58.08 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  54.29 
 
 
246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  55.24 
 
 
246 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3450  SAF domain-containing protein  45.15 
 
 
238 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  38.27 
 
 
243 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  37.82 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  27.15 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.85 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.87 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.75 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.89 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1505  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  39.02 
 
 
370 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.93 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  39.06 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.42 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.5 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.32 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.86 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.12 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.74 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  33.06 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.39 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.86 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  29.76 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3099  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  28.57 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.36 
 
 
358 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4424  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  38.33 
 
 
342 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.47 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 
380 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1318  flageller protein FlgA  27.17 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.91 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1953  flageller protein FlgA  24.49 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.48 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1382  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.83 
 
 
373 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.51 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0461  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.29 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.29 
 
 
320 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4711  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  36.59 
 
 
343 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0269631  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0153  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.76 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0673541  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1997  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.06 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3733  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.19 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.06 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2426  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.06 
 
 
269 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.13 
 
 
326 aa  55.8  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2959  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.34 
 
 
138 aa  55.5  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.569087  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.23 
 
 
235 aa  55.5  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3323  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.78 
 
 
254 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2992  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.78 
 
 
254 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2101  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.78 
 
 
254 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2560  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.84 
 
 
326 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  32.24 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  25.49 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.29 
 
 
360 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.65 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2412  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.83 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3026  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.83 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.124973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.61 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.65 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.95 
 
 
347 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  30.43 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2947  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.45 
 
 
424 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2519  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.39 
 
 
346 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3045  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.48 
 
 
408 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.279341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3021  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.03 
 
 
388 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2936  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.63 
 
 
418 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  24.32 
 
 
248 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0265  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.24 
 
 
509 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3071  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.13 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.08 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.85 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.85 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.85 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  24.7 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3270  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.33 
 
 
348 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132076  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0277  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.29 
 
 
507 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3244  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.26 
 
 
348 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1251  SAF domain-containing protein  29.57 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.792381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3046  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.15 
 
 
348 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1204  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.57 
 
 
286 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3715  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.67 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300126 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4792  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.67 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.245813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.61 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.69 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  33.05 
 
 
324 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2408  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.68 
 
 
316 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.47 
 
 
314 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.19 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1146  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.61 
 
 
280 aa  49.3  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000705954  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.61 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0634  SAF domain-containing protein  27.07 
 
 
254 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.23 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2606  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.89 
 
 
139 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.690909  hitchhiker  0.000478924 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0183  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.9 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0239  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.32 
 
 
538 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  24.32 
 
 
502 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  26.85 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2735  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.56 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000036483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>