60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2519 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2519  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  100 
 
 		 346 aa  686    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  58.68 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0393  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  50 
 
 		 416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3157  FlgA family protein  50.34 
 
 		 343 aa  294  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182361  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2408  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  36.79 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  27.83 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.77 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.09 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.44 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0396  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  33.33 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.77 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.13 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.95 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.77 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.12 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.77 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.98 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.46 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.29 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  30.77 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  31.58 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  39.47 
 
 		 252 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.3 
 
 		 243 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  28.39 
 
 		 236 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0332  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  31.33 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.77 
 
 		 244 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  46.55 
 
 		 262 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.57 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  30.37 
 
 		 235 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.95 
 
 		 235 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1505  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.35 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  26.42 
 
 		 238 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3450  SAF domain-containing protein  27.39 
 
 		 238 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.92 
 
 		 366 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1430  flagellar basal body P-ring formation protein FlgA  39.06 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.03 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.89 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.6 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  29.51 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1382  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.63 
 
 		 373 aa  46.2  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1204  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.42 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.4 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1251  SAF domain-containing protein  25.42 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.792381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0153  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.06 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0673541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.58 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.46 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4424  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.14 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2606  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.25 
 
 		 139 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.690909  hitchhiker  0.000478924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2600  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.5 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0634  SAF domain-containing protein  27.62 
 
 		 254 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  30.4 
 
 		 238 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1067  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  27.12 
 
 		 230 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0500277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  37.84 
 
 		 281 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.75 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.75 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>