78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2606 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2606  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 		 139 aa  266  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.690909  hitchhiker  0.000478924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  73.38 
 
 		 139 aa  189  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2986  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  74.8 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2959  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  50.38 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.569087  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4192  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  50.72 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  48.53 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2116  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  47.54 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  38.1 
 
 		 246 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  36.51 
 
 		 246 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.67 
 
 		 358 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4208  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  40.91 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1505  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.25 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.13 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.89 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.78 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0139  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  40 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.126341  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1140  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.8 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4424  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.4 
 
 		 342 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.11 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.11 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  32.28 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.48 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.38 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  40 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2560  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  40.28 
 
 		 326 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.85 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1382  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.05 
 
 		 373 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  34.53 
 
 		 262 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.59 
 
 		 250 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.56 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  31.78 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  35.66 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3652  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  34.65 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.265024  normal  0.613737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.95 
 
 		 380 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0741  flagellar protein FLGA precursor  34.38 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0353  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.26 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0779084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1430  flagellar basal body P-ring formation protein FlgA  29.17 
 
 		 247 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.8 
 
 		 242 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3677  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.17 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  30.89 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.17 
 
 		 245 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.01 
 
 		 232 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.89 
 
 		 225 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.42 
 
 		 232 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3450  SAF domain-containing protein  27.61 
 
 		 238 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.93 
 
 		 252 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  42.11 
 
 		 324 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  34.83 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  44.26 
 
 		 262 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0600  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  29.85 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.03 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.77 
 
 		 232 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0028  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  35.87 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1251  SAF domain-containing protein  26.72 
 
 		 280 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.792381  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  30.25 
 
 		 265 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.96 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0259  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.68 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1204  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.72 
 
 		 286 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.43 
 
 		 252 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2519  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.25 
 
 		 346 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0622  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  32.93 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1621  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  33.65 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.99379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0633  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.93 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683972  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3475  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.81 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  0.226708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1667  SAF domain-containing protein  35.64 
 
 		 220 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0285706  normal  0.0223533 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2408  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.21 
 
 		 316 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2704  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.04 
 
 		 423 aa  41.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0294  flagellar protein FlgA  33.33 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1997  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.17 
 
 		 254 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0036  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  35.64 
 
 		 222 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0393  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32 
 
 		 416 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0183  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.65 
 
 		 257 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.17 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0824  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.83 
 
 		 379 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2426  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.17 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  24.8 
 
 		 248 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>