119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3280 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  100 
 
 
243 aa  471  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  39.92 
 
 
238 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  43.75 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  38.66 
 
 
248 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  42.79 
 
 
246 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  40.98 
 
 
236 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3450  SAF domain-containing protein  43.69 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  36.2 
 
 
240 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  32.04 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.8 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2936  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.85 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.31 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3071  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.85 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.65 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.95 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0461  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.58 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0239  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.06 
 
 
538 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3323  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.8 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2992  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.8 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2101  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.8 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2986  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.68 
 
 
139 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2412  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3026  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.124973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  32.42 
 
 
502 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  36.02 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1953  flageller protein FlgA  29.41 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3045  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.77 
 
 
408 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.279341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.76 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2116  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  40.34 
 
 
138 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0265  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.58 
 
 
509 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0277  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.58 
 
 
507 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3021  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.92 
 
 
388 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1251  SAF domain-containing protein  27.13 
 
 
280 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.792381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1204  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.13 
 
 
286 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.09 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3795  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.14 
 
 
504 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.36 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.59 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  29.09 
 
 
238 aa  58.9  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2519  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.23 
 
 
346 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.74 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2606  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.85 
 
 
139 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.690909  hitchhiker  0.000478924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.76 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3733  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.88 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  34.43 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.6 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  26.98 
 
 
235 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1318  flageller protein FlgA  25.57 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.95 
 
 
355 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.98 
 
 
214 aa  55.1  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.98 
 
 
214 aa  55.1  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  27.01 
 
 
324 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4419  SAF domain-containing protein  27.98 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  33.87 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2947  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.74 
 
 
424 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.81 
 
 
141 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.36 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  25.85 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2408  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.7 
 
 
316 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  26.4 
 
 
262 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02933  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.58 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870868  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0153  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  24.29 
 
 
235 aa  52.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0673541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.34 
 
 
235 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1158  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.23 
 
 
235 aa  52  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.623618  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2959  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.16 
 
 
138 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.569087  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.07 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.26 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.58 
 
 
347 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.89 
 
 
380 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3099  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.22 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3826  SAF domain-containing protein  28.22 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.294228 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3715  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.29 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.24 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2426  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.24 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  30.28 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4792  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.29 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.245813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.72 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.58 
 
 
360 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.36 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.62 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1997  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.24 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  29.41 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.23 
 
 
233 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.23 
 
 
233 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3099  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  26.74 
 
 
236 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3074  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  29.73 
 
 
239 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.15 
 
 
235 aa  49.3  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.36 
 
 
358 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.71 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.277542  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.89 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1867  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.04 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.563349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  26.03 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2735  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.43 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000036483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3713  flageller protein FlgA  26.83 
 
 
246 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.77 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2924  hypothetical protein  41.33 
 
 
180 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.818102  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16560  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  23.27 
 
 
336 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0109519  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.95 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.56 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>