More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1661 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1661  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
302 aa  583  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.22 
 
 
320 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759564  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4136  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137043  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3662  alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4364  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 
319 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378337  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2841  alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2677  putative zinc-binding dehydrogenase  42.77 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3277  alcohol dehydrogenase  42.27 
 
 
320 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.124844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4126  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.27 
 
 
320 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4240  alcohol dehydrogenase  42.27 
 
 
320 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1771  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.63 
 
 
321 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278592  normal  0.0140179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6713  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.45 
 
 
321 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0946  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.38 
 
 
372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1031  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.38 
 
 
372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1132  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.06 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2272  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.06 
 
 
321 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0108  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.06 
 
 
346 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.45338  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3046  alcohol dehydrogenase  43.51 
 
 
281 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1506  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.12 
 
 
666 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.68895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.08 
 
 
325 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.82 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2294  alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 
319 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306144  hitchhiker  0.00260878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2350  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.1 
 
 
319 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1358  NADPH:quinone reductase or related Zn-dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
315 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0269743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3912  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
322 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.83 
 
 
314 aa  128  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3085  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
320 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
326 aa  96.3  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
326 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  32.12 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  31.39 
 
 
325 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.5 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
325 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 
323 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.02 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.21 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
324 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.82 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.62 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.99 
 
 
325 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08518  Putative uncharacterized proteinTdiC ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AT62]  36.2 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554432  normal  0.01647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  33.09 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  31.39 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2916  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.48 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.4 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1915  alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.35 
 
 
323 aa  79  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5154  alcohol dehydrogenase  37.4 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266092  normal  0.177147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0905  alcohol dehydrogenase  32.97 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.586977  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6140  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.91 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0617  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.03 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.53 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  30 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.49 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.08 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.7 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.36 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.7 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1096  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.92 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.74 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.77 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1609  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.48 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.203657  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  30.33 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.77 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  30.68 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.51 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.48 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.56 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.48 
 
 
317 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.5 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.87 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>