More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4126 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4240  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
320 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4126  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
320 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3277  alcohol dehydrogenase  99.06 
 
 
320 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.124844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1771  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  87.7 
 
 
321 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278592  normal  0.0140179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4136  alcohol dehydrogenase  80.82 
 
 
321 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137043  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3662  alcohol dehydrogenase  80.82 
 
 
321 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4364  alcohol dehydrogenase  77.53 
 
 
319 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378337  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0108  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  74.53 
 
 
346 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.45338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0946  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  74.53 
 
 
372 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1506  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  74.53 
 
 
666 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.68895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2272  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  74.84 
 
 
321 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1031  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  74.53 
 
 
372 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1132  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  74.21 
 
 
321 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2677  putative zinc-binding dehydrogenase  63.72 
 
 
319 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60 
 
 
320 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759564  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3046  alcohol dehydrogenase  56.58 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2350  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 
319 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.62 
 
 
318 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2841  alcohol dehydrogenase  40.26 
 
 
323 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6713  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.51 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.16 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1661  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.9 
 
 
302 aa  185  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3912  alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
322 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1358  NADPH:quinone reductase or related Zn-dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
315 aa  175  7e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0269743  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2294  alcohol dehydrogenase  38.96 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306144  hitchhiker  0.00260878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.41 
 
 
314 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3085  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.11 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5154  alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 
302 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266092  normal  0.177147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1915  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  30.56 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  30.56 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.24 
 
 
318 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30 
 
 
328 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  30.56 
 
 
328 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
328 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.94 
 
 
328 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.94 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  30.25 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  29.63 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5520  putative dehydrogenase/oxidoreductase  33.64 
 
 
313 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566328  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1673  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.55 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.69 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.75 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  33.19 
 
 
324 aa  85.9  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08518  Putative uncharacterized proteinTdiC ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AT62]  27.43 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554432  normal  0.01647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2916  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.52 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.63 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.98 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.45 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.92 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1609  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.78 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.203657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.92 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0050  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.11 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.5 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1498  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  40.31 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  37.41 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.64 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.75 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.83 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.69 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.47 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  33.19 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  32.93 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2497  alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0063447  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1409  alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395097  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.83 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.83 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.73 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  34.72 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  33.18 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.62 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  29.78 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.26 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0899  putative NADPH:quinone oxidoreductase protein  41.22 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.504483  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  29 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.44 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.8 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.63 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.6 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.49 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.38 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.4 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.76 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.96 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  34.16 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>