More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2294 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2294  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
319 aa  610  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306144  hitchhiker  0.00260878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3912  alcohol dehydrogenase  48.9 
 
 
322 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2350  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.28 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3085  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 
320 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
320 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759564  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.23 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3046  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
281 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0108  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.39 
 
 
346 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.45338  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2677  putative zinc-binding dehydrogenase  36.65 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1506  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.39 
 
 
666 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.68895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2272  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.39 
 
 
321 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0946  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.07 
 
 
372 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1031  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.07 
 
 
372 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1132  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  42.07 
 
 
321 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4364  alcohol dehydrogenase  39.75 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378337  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4126  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4240  alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.27 
 
 
314 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1771  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.33 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278592  normal  0.0140179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3277  alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 
320 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.124844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4136  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
321 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137043  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3662  alcohol dehydrogenase  37.04 
 
 
321 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2841  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
323 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6713  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.3 
 
 
321 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1661  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.23 
 
 
302 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1358  NADPH:quinone reductase or related Zn-dependent oxidoreductase  35.87 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0269743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.34 
 
 
325 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5154  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
302 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266092  normal  0.177147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1915  alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
308 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0050  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.86 
 
 
325 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.51 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.08 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.88 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2916  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.55 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  32.88 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  33.48 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.81 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.36 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  25.54 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1609  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.38 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.203657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  25.5 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.39 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.2 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.84 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.4 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.55 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.97 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.22 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  25.62 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  25.85 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.39 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  25.62 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08518  Putative uncharacterized proteinTdiC ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AT62]  31.74 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554432  normal  0.01647 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.29 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  28.52 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.23 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  30.21 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.5 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.9 
 
 
639 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.89 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.85 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  30.31 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.97 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4263  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.63 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  30.41 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37060  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  30.99 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.53 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  27.97 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2788  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.4 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.08 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.71 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  25.23 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.78 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  25.78 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  30.04 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.36 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.98 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  25.59 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  30.56 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1096  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.85 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.54 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  25.08 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.98 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.75 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3729  alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>