More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6202 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
328 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4166  alcohol dehydrogenase  79.51 
 
 
328 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  78.59 
 
 
328 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  77.91 
 
 
326 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.58 
 
 
328 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1258  alcohol dehydrogenase  62.58 
 
 
340 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0491  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.58 
 
 
331 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5758  alcohol dehydrogenase  62.15 
 
 
328 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0529264 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2768  alcohol dehydrogenase  60.91 
 
 
343 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0447  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.04 
 
 
337 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.67 
 
 
331 aa  359  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2634  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.9 
 
 
336 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.02 
 
 
343 aa  355  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3909  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.84 
 
 
332 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.02 
 
 
333 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0908674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3235  alcohol dehydrogenase  58.41 
 
 
333 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.721044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.08 
 
 
335 aa  339  4e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2710  alcohol dehydrogenase  58.41 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2386  alcohol dehydrogenase  60.86 
 
 
334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357154  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1153  putative NADPH quinone oxidoreductase  58.84 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  42.51 
 
 
331 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  42.51 
 
 
331 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.2 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  41.9 
 
 
331 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  42.2 
 
 
331 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.69 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  41.69 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10198  ripening-induced protein-putative Zn-containing oxidoreductase  42.38 
 
 
329 aa  253  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.622763  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.65 
 
 
330 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.18 
 
 
328 aa  249  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1848  alcohol dehydrogenase  48.19 
 
 
330 aa  242  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1357  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  38.48 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1606  putative adh_zinc, zinc-binding dehydrogenase  37.65 
 
 
325 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.265737 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.76 
 
 
639 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.77 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.34 
 
 
337 aa  196  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 
317 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.26 
 
 
334 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.47 
 
 
334 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.05 
 
 
332 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.05 
 
 
332 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.76 
 
 
332 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3184  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.88 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.34 
 
 
334 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 
320 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.47 
 
 
332 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.36 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.17 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.17 
 
 
332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.89 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.88 
 
 
332 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.18 
 
 
310 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0216  putative zinc-binding oxidoreductase  37.57 
 
 
338 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.591526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.14 
 
 
334 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
335 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  36.47 
 
 
304 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  38.3 
 
 
307 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
333 aa  175  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
308 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.9 
 
 
333 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
312 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2551  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.59 
 
 
332 aa  170  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2788  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.13 
 
 
332 aa  169  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.47 
 
 
333 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1998  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.21 
 
 
318 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.14 
 
 
331 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
331 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  34.8 
 
 
333 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  38.91 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
333 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1501  alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640721  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.28 
 
 
333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.86 
 
 
333 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  35.37 
 
 
305 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.21 
 
 
333 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.78 
 
 
333 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2916  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.88 
 
 
333 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14300  putative zinc-binding oxidoreductase  41.29 
 
 
375 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.68 
 
 
333 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.72 
 
 
338 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
337 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
339 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  45.09 
 
 
314 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.72 
 
 
311 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.13 
 
 
308 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  40.08 
 
 
308 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.75 
 
 
330 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
333 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.15 
 
 
308 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 
314 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.34 
 
 
319 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
339 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.87 
 
 
334 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  48 
 
 
313 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  36.63 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1832  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.612852  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>