More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2634 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2634  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
336 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.23 
 
 
328 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3235  alcohol dehydrogenase  64.13 
 
 
333 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.721044 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.23 
 
 
326 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  64.13 
 
 
333 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0908674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5758  alcohol dehydrogenase  61.54 
 
 
328 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0529264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3909  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.88 
 
 
332 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2710  alcohol dehydrogenase  63.22 
 
 
333 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.45 
 
 
331 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.74 
 
 
328 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.9 
 
 
328 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1258  alcohol dehydrogenase  58.9 
 
 
340 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4166  alcohol dehydrogenase  61.96 
 
 
328 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.57 
 
 
343 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0491  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.23 
 
 
331 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.19 
 
 
335 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0447  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.88 
 
 
337 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1153  putative NADPH quinone oxidoreductase  58.59 
 
 
343 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2768  alcohol dehydrogenase  53.39 
 
 
343 aa  328  6e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2386  alcohol dehydrogenase  52.12 
 
 
334 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357154  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10198  ripening-induced protein-putative Zn-containing oxidoreductase  46.65 
 
 
329 aa  279  6e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.622763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  45.15 
 
 
331 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  44.85 
 
 
331 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.85 
 
 
331 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.55 
 
 
331 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.18 
 
 
335 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  45.18 
 
 
335 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.24 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.77 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.33 
 
 
328 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1606  putative adh_zinc, zinc-binding dehydrogenase  43.43 
 
 
325 aa  255  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.265737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1357  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.93 
 
 
326 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  41.99 
 
 
337 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  41.64 
 
 
325 aa  242  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1848  alcohol dehydrogenase  46.97 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.68 
 
 
330 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.69 
 
 
639 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3184  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.7 
 
 
331 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.09 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.49 
 
 
334 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.62 
 
 
334 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.92 
 
 
334 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0216  putative zinc-binding oxidoreductase  40.83 
 
 
338 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.591526 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 
317 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.02 
 
 
317 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.12 
 
 
333 aa  199  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.46 
 
 
333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2788  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.66 
 
 
332 aa  192  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.91 
 
 
320 aa  193  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.29 
 
 
332 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
332 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.29 
 
 
332 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.29 
 
 
332 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38 
 
 
333 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.29 
 
 
332 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.43 
 
 
333 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.94 
 
 
332 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.55 
 
 
332 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1998  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.79 
 
 
318 aa  186  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35 
 
 
332 aa  185  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.84 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.89 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  38.79 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  38.69 
 
 
335 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
333 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1832  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.14 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.612852  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.69 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  37.27 
 
 
308 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14300  putative zinc-binding oxidoreductase  42.12 
 
 
375 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.61 
 
 
331 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
333 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2551  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.05 
 
 
332 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.39 
 
 
332 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.05 
 
 
317 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
317 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.02 
 
 
335 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 
333 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
313 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.14 
 
 
317 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 
317 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
327 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 
333 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
321 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  35.14 
 
 
308 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1501  alcohol dehydrogenase  39.7 
 
 
324 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640721  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
333 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.24 
 
 
333 aa  169  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  35.84 
 
 
317 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
337 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.97 
 
 
314 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2916  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.82 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
339 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.69 
 
 
338 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  42.13 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.6 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.43 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.11 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>