More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3909 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3909  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
332 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.03 
 
 
328 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2634  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.88 
 
 
336 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.97 
 
 
331 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1258  alcohol dehydrogenase  61.14 
 
 
340 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5758  alcohol dehydrogenase  59.69 
 
 
328 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0529264 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.66 
 
 
326 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.84 
 
 
328 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0491  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.35 
 
 
331 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.88 
 
 
333 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0908674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0447  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.43 
 
 
337 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3235  alcohol dehydrogenase  62.27 
 
 
333 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.721044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2710  alcohol dehydrogenase  62.88 
 
 
333 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.74 
 
 
343 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.45 
 
 
328 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4166  alcohol dehydrogenase  59.15 
 
 
328 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.02 
 
 
335 aa  345  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1153  putative NADPH quinone oxidoreductase  58.97 
 
 
343 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2768  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
343 aa  325  6e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2386  alcohol dehydrogenase  56.16 
 
 
334 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357154  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10198  ripening-induced protein-putative Zn-containing oxidoreductase  45.29 
 
 
329 aa  273  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.622763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  43.77 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  43.77 
 
 
331 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.61 
 
 
328 aa  266  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.98 
 
 
330 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.47 
 
 
331 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.16 
 
 
331 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.77 
 
 
331 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.24 
 
 
335 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 
335 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1357  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.22 
 
 
326 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1848  alcohol dehydrogenase  48.94 
 
 
330 aa  246  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  41.57 
 
 
325 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1606  putative adh_zinc, zinc-binding dehydrogenase  40.92 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.265737 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  40.54 
 
 
337 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.12 
 
 
330 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.95 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.95 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3184  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.22 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.86 
 
 
334 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.3 
 
 
333 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2551  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.14 
 
 
332 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  36.97 
 
 
308 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.35 
 
 
334 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.26 
 
 
639 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0216  putative zinc-binding oxidoreductase  37.54 
 
 
338 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.591526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.69 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1832  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.612852  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 
317 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
335 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.09 
 
 
310 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.72 
 
 
332 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.72 
 
 
332 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.43 
 
 
332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.43 
 
 
332 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.72 
 
 
332 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1501  alcohol dehydrogenase  40.94 
 
 
324 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640721  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.43 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.43 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.23 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2788  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.02 
 
 
332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.43 
 
 
332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  36.86 
 
 
308 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  32.93 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  37.03 
 
 
323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  41.63 
 
 
321 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.06 
 
 
317 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  34.06 
 
 
317 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.8 
 
 
333 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.85 
 
 
310 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.75 
 
 
317 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.44 
 
 
331 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.92 
 
 
308 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  34.89 
 
 
331 aa  159  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  33.83 
 
 
308 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  38.59 
 
 
317 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 
318 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1998  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.58 
 
 
318 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  33.44 
 
 
317 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
325 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.82 
 
 
335 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.66 
 
 
333 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.14 
 
 
314 aa  155  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.17 
 
 
317 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2916  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.04 
 
 
333 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14300  putative zinc-binding oxidoreductase  41.81 
 
 
375 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
339 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
313 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.68 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
320 aa  152  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.83 
 
 
330 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.63 
 
 
335 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.82 
 
 
332 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.24 
 
 
314 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.38 
 
 
333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.63 
 
 
323 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
333 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>