More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1357 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1357  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
326 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10198  ripening-induced protein-putative Zn-containing oxidoreductase  66.67 
 
 
329 aa  447  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.622763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1848  alcohol dehydrogenase  68.1 
 
 
330 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  54.63 
 
 
331 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  54.63 
 
 
331 aa  352  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  54.32 
 
 
331 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  54.01 
 
 
331 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.66 
 
 
335 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  53.66 
 
 
335 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  53.7 
 
 
331 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.52 
 
 
330 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  50.61 
 
 
325 aa  311  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.15 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1606  putative adh_zinc, zinc-binding dehydrogenase  48.48 
 
 
325 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.265737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.17 
 
 
328 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.4 
 
 
335 aa  268  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1258  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
340 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6116  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.17 
 
 
326 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4732  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.69 
 
 
328 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5758  alcohol dehydrogenase  47.12 
 
 
328 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0529264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2634  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.93 
 
 
336 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3909  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.91 
 
 
332 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.55 
 
 
328 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.34 
 
 
331 aa  242  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3833  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47 
 
 
343 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1153  putative NADPH quinone oxidoreductase  48.4 
 
 
343 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3235  alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 
333 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22268  normal  0.721044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.51 
 
 
334 aa  223  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2710  alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 
333 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.02 
 
 
333 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0908674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0491  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.27 
 
 
331 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0447  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.95 
 
 
337 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35985  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2386  alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 
334 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357154  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  40.12 
 
 
337 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4166  alcohol dehydrogenase  43.31 
 
 
328 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.82 
 
 
330 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2768  alcohol dehydrogenase  41.25 
 
 
343 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.87 
 
 
334 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.87 
 
 
334 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.46 
 
 
639 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.6 
 
 
317 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3184  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.85 
 
 
331 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
317 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.54 
 
 
333 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.43 
 
 
334 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.18 
 
 
332 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.88 
 
 
332 aa  185  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.29 
 
 
332 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0216  putative zinc-binding oxidoreductase  38.39 
 
 
338 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.591526 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.71 
 
 
332 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.71 
 
 
332 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.71 
 
 
332 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  34.71 
 
 
332 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.45 
 
 
310 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.71 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.41 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.56 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.31 
 
 
326 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.15 
 
 
317 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  33.85 
 
 
317 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
332 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2788  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.48 
 
 
332 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
312 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.01 
 
 
333 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1832  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
331 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.612852  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  34.34 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.78 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1998  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.47 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2551  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.83 
 
 
332 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.43 
 
 
332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.79 
 
 
331 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1501  alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
324 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640721  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.04 
 
 
334 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.73 
 
 
314 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.52 
 
 
335 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2916  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.27 
 
 
333 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
308 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
318 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  35.08 
 
 
307 aa  159  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.65 
 
 
334 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
325 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.65 
 
 
326 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
313 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  33.64 
 
 
332 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.87 
 
 
335 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  35.51 
 
 
336 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.34 
 
 
338 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14300  putative zinc-binding oxidoreductase  38.97 
 
 
375 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.83 
 
 
336 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.86 
 
 
332 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.2 
 
 
336 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
333 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.13 
 
 
334 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
332 aa  152  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.84 
 
 
328 aa  152  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.29 
 
 
333 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>