More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3085 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3085  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
320 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2294  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 
319 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.306144  hitchhiker  0.00260878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3912  alcohol dehydrogenase  40.94 
 
 
322 aa  218  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2350  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 
320 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759564  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4364  alcohol dehydrogenase  38.27 
 
 
319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.378337  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4136  alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137043  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3662  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
321 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2677  putative zinc-binding dehydrogenase  35.52 
 
 
319 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0108  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.42 
 
 
346 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.45338  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2272  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.42 
 
 
321 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0946  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.42 
 
 
372 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4126  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
320 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1031  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.42 
 
 
372 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4240  alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
320 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.290986  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1771  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.18 
 
 
321 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.278592  normal  0.0140179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3277  alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.124844 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1506  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.42 
 
 
666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.68895  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1132  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  41.04 
 
 
321 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3046  alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.36 
 
 
314 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.38 
 
 
318 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1661  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.8 
 
 
302 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6713  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.33 
 
 
321 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.14 
 
 
325 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5154  alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266092  normal  0.177147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2841  alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57822  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1358  NADPH:quinone reductase or related Zn-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0269743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5520  putative dehydrogenase/oxidoreductase  37.05 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566328  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.21 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1915  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1673  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.97 
 
 
316 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.98 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.11 
 
 
318 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.13 
 
 
331 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.57 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.49 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  30.99 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2916  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.23 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.74 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30.13 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  30.57 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.96 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.95 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.69 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.89 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  31.51 
 
 
304 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1488  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.61 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.64 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.9 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.09 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  34.67 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.31 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.19 
 
 
307 aa  79  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  33.78 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.28 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.01 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.36 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.13 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1096  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.65 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.9 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.02 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.78 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.73 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  33.47 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.06 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4426  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6510  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.71 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.267083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.68 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3312  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.06 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.94 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  30.58 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  30.58 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>