More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1488 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1488  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
292 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  32 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3312  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
320 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
324 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.97 
 
 
325 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.52 
 
 
326 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
325 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
333 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
319 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 
323 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.87 
 
 
324 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 
324 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.78 
 
 
325 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 
339 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.7 
 
 
322 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.45 
 
 
326 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 
326 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.09 
 
 
326 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.57 
 
 
320 aa  95.9  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0239  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
321 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
326 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
323 aa  95.5  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  31.38 
 
 
331 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.1 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
335 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  29.13 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  28.09 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  26.75 
 
 
328 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0013  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.61 
 
 
328 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0388317  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.41 
 
 
327 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4095  alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
318 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 
329 aa  93.2  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 
319 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.38 
 
 
327 aa  92.4  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  27.08 
 
 
325 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.7 
 
 
328 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  26.14 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
329 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.31 
 
 
324 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  28.39 
 
 
322 aa  89.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.46 
 
 
328 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.7 
 
 
323 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.27 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  31.61 
 
 
319 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  26.51 
 
 
327 aa  89  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5520  putative dehydrogenase/oxidoreductase  32.64 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566328  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.91 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0231  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
320 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000570336  unclonable  8.70956e-23 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
323 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
335 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.65 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.61 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  29.45 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  27.69 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.1 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.36 
 
 
332 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.49 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
326 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
341 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  26.63 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.31 
 
 
323 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  30.84 
 
 
308 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  26.44 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.44 
 
 
328 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.3 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1307  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  23.05 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.41 
 
 
338 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.64 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.74 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0444759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  26.67 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  29.22 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  26.91 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.46 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6510  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.75 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.267083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.22 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.51 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  25.68 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  26.14 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  26.14 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3184  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.33 
 
 
331 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.14 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1784  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.15 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3073  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.42 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4130  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.69 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.1 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>