More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0651 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0651  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 
183 aa  367  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.659194  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1626  nucleoside diphosphate kinase  85.79 
 
 
183 aa  326  9e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.975715  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0653  nucleoside diphosphate kinase  81.97 
 
 
183 aa  317  7.999999999999999e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0523  nucleoside diphosphate kinase  76.92 
 
 
182 aa  300  1e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0429  nucleoside diphosphate kinase  62.3 
 
 
186 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.835246  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  40.33 
 
 
150 aa  136  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  42.78 
 
 
148 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0475  nucleoside diphosphate kinase  35.52 
 
 
169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  35.91 
 
 
138 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3326  nucleoside-diphosphate kinase  40.11 
 
 
144 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  40.22 
 
 
141 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  37.57 
 
 
149 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  39.56 
 
 
141 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2331  Nucleoside-diphosphate kinase  38.46 
 
 
168 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.521222  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  38.89 
 
 
149 aa  121  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1286  nucleoside diphosphate kinase  41.38 
 
 
139 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1390  nucleoside diphosphate kinase  40.8 
 
 
139 aa  121  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  37.02 
 
 
149 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  39.67 
 
 
143 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  39.56 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  39.67 
 
 
142 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  36.26 
 
 
143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  40.66 
 
 
141 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  37.5 
 
 
141 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  34.81 
 
 
166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0381  nucleoside-diphosphate kinase  37.57 
 
 
147 aa  117  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  37.7 
 
 
154 aa  117  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  38.8 
 
 
141 aa  117  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  36.26 
 
 
139 aa  117  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0387  nucleoside diphosphate kinase  37.57 
 
 
141 aa  117  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  39.46 
 
 
159 aa  117  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  38.25 
 
 
141 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  38.04 
 
 
143 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  37.36 
 
 
143 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  37.08 
 
 
152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  35.91 
 
 
139 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  37.36 
 
 
143 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  38.59 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  38.59 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  38.59 
 
 
143 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  34.81 
 
 
148 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  34.81 
 
 
148 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  34.81 
 
 
148 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  34.81 
 
 
148 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1478  nucleoside diphosphate kinase  38.8 
 
 
141 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  38.04 
 
 
143 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  34.81 
 
 
148 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  35.52 
 
 
144 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  34.81 
 
 
148 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  37.78 
 
 
152 aa  115  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  34.81 
 
 
148 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  39.13 
 
 
143 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  37.36 
 
 
143 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0670  nucleoside diphosphate kinase  38.51 
 
 
139 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  37.36 
 
 
144 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  33.7 
 
 
148 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  34.81 
 
 
149 aa  115  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  35.91 
 
 
141 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  35.91 
 
 
141 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  33.7 
 
 
148 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  37.36 
 
 
143 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  38.04 
 
 
143 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  37.7 
 
 
141 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  37.7 
 
 
141 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  32.6 
 
 
149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  38.04 
 
 
143 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  38.04 
 
 
143 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  38.04 
 
 
143 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  38.04 
 
 
143 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  38.04 
 
 
143 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  37.16 
 
 
141 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  37.5 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  37.36 
 
 
141 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  36.26 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  37.16 
 
 
141 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  35.71 
 
 
143 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  32.78 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  36.61 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  36.96 
 
 
143 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  36.96 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  35.87 
 
 
143 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  35.56 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  34.43 
 
 
140 aa  112  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  34.25 
 
 
148 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0907  nucleoside-diphosphate kinase  35.71 
 
 
148 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  36.07 
 
 
143 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  36.07 
 
 
143 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  38.51 
 
 
135 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  36.46 
 
 
142 aa  111  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1295  nucleoside diphosphate kinase  35.06 
 
 
140 aa  111  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0619  nucleoside-diphosphate kinase  35 
 
 
141 aa  111  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  34.86 
 
 
136 aa  111  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  38.64 
 
 
137 aa  111  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  37.93 
 
 
134 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  39.2 
 
 
137 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0038  nucleoside-diphosphate kinase  35.91 
 
 
147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  37.91 
 
 
137 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  36.21 
 
 
139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  35.71 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  37.57 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>