More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0233 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1266  GTP-binding protein LepA  54.59 
 
 		 600 aa  684    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00508967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1431  GTP-binding protein LepA  51.42 
 
 		 599 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1241  GTP-binding protein LepA  52.26 
 
 		 595 aa  658    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1893  GTP-binding protein LepA  55.93 
 
 		 601 aa  694    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1152  GTP-binding protein LepA  52.92 
 
 		 607 aa  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1466  GTP-binding protein LepA  52 
 
 		 601 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1060  GTP-binding protein LepA  54.17 
 
 		 598 aa  648    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.568837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4400  GTP-binding protein LepA  55.95 
 
 		 607 aa  715    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.751687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4124  GTP-binding protein LepA  51.59 
 
 		 596 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0906  GTP-binding protein LepA  56.67 
 
 		 610 aa  703    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1039  GTP-binding protein LepA  53.24 
 
 		 602 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1346  GTP-binding protein LepA  50.92 
 
 		 596 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4220  GTP-binding protein LepA  51.26 
 
 		 595 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4218  GTP-binding protein LepA  55.78 
 
 		 607 aa  712    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4056  GTP-binding protein LepA  55.78 
 
 		 607 aa  712    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000612977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4066  GTP-binding protein LepA  55.78 
 
 		 607 aa  712    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0084757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0541  GTP-binding protein LepA  54.61 
 
 		 597 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1837  GTP-binding protein LepA  50 
 
 		 610 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1834  GTP-binding protein LepA  49.83 
 
 		 610 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3954  GTP-binding protein LepA  51.09 
 
 		 598 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0330  GTP-binding protein LepA  50.59 
 
 		 598 aa  640    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2026  GTP-binding protein LepA  53.6 
 
 		 596 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.788972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0829  GTP-binding protein LepA  53.03 
 
 		 614 aa  666    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1754  GTP-binding protein LepA  52.17 
 
 		 603 aa  651    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2255  GTP-binding protein LepA  53.92 
 
 		 597 aa  663    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.357862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2089  GTP-binding protein LepA  52.27 
 
 		 599 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0343  GTP-binding protein LepA  52.09 
 
 		 603 aa  663    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.697436  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0440  GTP-binding protein LepA  54.53 
 
 		 603 aa  686    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239909  normal  0.261131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2897  GTP-binding protein LepA  54.61 
 
 		 597 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2461  GTP-binding protein LepA  52.42 
 
 		 606 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0992  GTP-binding protein LepA  50.92 
 
 		 598 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.376719  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2088  GTP-binding protein LepA  50.67 
 
 		 599 aa  641    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1618  GTP-binding protein LepA  54.19 
 
 		 599 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000183904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4244  GTP-binding protein LepA  54.68 
 
 		 597 aa  683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1471  GTP-binding protein LepA  55.83 
 
 		 605 aa  704    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1582  GTP-binding protein LepA  52.42 
 
 		 602 aa  645    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.314683  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0490  GTP-binding protein LepA  54.1 
 
 		 605 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0799  GTP-binding protein LepA  52.92 
 
 		 606 aa  655    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.274116  normal  0.0311101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1766  GTP-binding protein LepA  54.09 
 
 		 629 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000017953  normal  0.0160194 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2817  GTP-binding protein LepA  53.68 
 
 		 601 aa  688    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4544  GTP-binding protein LepA  55.78 
 
 		 607 aa  712    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0416  GTP-binding protein LepA  53.02 
 
 		 602 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0479  GTP-binding protein LepA  54.77 
 
 		 604 aa  673    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1751  GTP-binding protein LepA  55.26 
 
 		 597 aa  692    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.951642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0581  GTP-binding protein LepA  56.19 
 
 		 602 aa  710    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.810707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1728  GTP-binding protein LepA  54.77 
 
 		 597 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1614  GTP-binding protein LepA  53.77 
 
 		 601 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1262  GTP-binding protein LepA  53.37 
 
 		 682 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0724  GTP-binding protein LepA  51.26 
 
 		 598 aa  641    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3431  GTP-binding protein LepA  51.42 
 
 		 599 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1740  GTP-binding protein LepA  52.98 
 
 		 603 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0723803  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2246  GTP-binding protein LepA  51.93 
 
 		 599 aa  648    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0860  GTP-binding protein LepA  55.61 
 
 		 597 aa  684    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0198649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1004  GTP-binding protein LepA  55.61 
 
 		 597 aa  684    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0141271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3638  GTP-binding protein LepA  52.48 
 
 		 603 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1083  GTP-binding protein LepA  54.44 
 
 		 597 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.632342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2768  GTP-binding protein LepA  51.92 
 
 		 596 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000363833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0438  GTP-binding protein LepA  51.75 
 
 		 610 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.587658  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0364  GTP-binding protein LepA  50.59 
 
 		 598 aa  639    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2421  GTP-binding protein LepA  53.76 
 
 		 597 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.417593  normal  0.344469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0244  GTP-binding protein LepA  55.44 
 
 		 601 aa  691    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1624  GTP-binding protein LepA  57.62 
 
 		 595 aa  682    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.440773  normal  0.182126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0678  GTP-binding protein LepA  51.09 
 
 		 599 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0691872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2036  GTP-binding protein LepA  51.24 
 
 		 607 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.270198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0652  GTP-binding protein LepA  55.02 
 
 		 597 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3493  GTP-binding protein LepA  52.95 
 
 		 639 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1516  GTP-binding protein LepA  53.11 
 
 		 600 aa  671    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3151  GTP-binding protein LepA  52.51 
 
 		 598 aa  651    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000523336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4075  GTP-binding protein LepA  52.17 
 
 		 605 aa  660    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1717  GTP-binding protein LepA  53.33 
 
 		 596 aa  668    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000391378  normal  0.794394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2295  GTP-binding protein LepA  56.78 
 
 		 600 aa  689    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2010  GTP-binding protein LepA  56.62 
 
 		 600 aa  689    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1242  GTP-binding protein LepA  52.08 
 
 		 598 aa  650    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2425  GTP-binding protein LepA  53.94 
 
 		 601 aa  675    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2850  GTP-binding protein LepA  51.42 
 
 		 596 aa  651    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2932  GTP-binding protein LepA  51.42 
 
 		 596 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000771458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1344  GTP-binding protein LepA  50.92 
 
 		 627 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.269651  normal  0.813727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2931  GTP-binding protein LepA  51.59 
 
 		 596 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0135754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1583  GTP-binding protein LepA  54.26 
 
 		 599 aa  674    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0013667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0148  GTP-binding protein LepA  51.17 
 
 		 608 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1008  GTP-binding protein LepA  54.85 
 
 		 597 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54370  GTP-binding protein LepA  52.51 
 
 		 599 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1210  GTP-binding protein LepA  55.78 
 
 		 607 aa  691    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0581  GTP-binding protein LepA  53.91 
 
 		 623 aa  647    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0824  GTP-binding protein LepA  51.99 
 
 		 612 aa  658    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1191  GTP-binding protein LepA  52.59 
 
 		 620 aa  652    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.859695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0932  GTP-binding protein LepA  57.19 
 
 		 610 aa  705    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0636523  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2240  GTP-binding protein LepA  52.67 
 
 		 617 aa  658    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.191927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1132  GTP-binding protein LepA  55.02 
 
 		 597 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1361  GTP-binding protein LepA  53.69 
 
 		 598 aa  648    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.194273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0905  GTP-binding protein LepA  52.26 
 
 		 598 aa  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.446358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3028  GTP-binding protein LepA  51.25 
 
 		 596 aa  651    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000110121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0778  GTP-binding protein LepA  53.29 
 
 		 606 aa  665    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0607569  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2331  GTP-binding protein LepA  52.93 
 
 		 598 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1859  GTP-binding protein LepA  55.67 
 
 		 605 aa  696    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.365032  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4417  GTP-binding protein LepA  50.51 
 
 		 614 aa  641    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0878  GTP-binding protein LepA  51.92 
 
 		 596 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0457897  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3556  GTP-binding protein LepA  52.95 
 
 		 639 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3881  GTP-binding protein LepA  52.08 
 
 		 652 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2261  GTP-binding protein LepA  53.09 
 
 		 607 aa  691    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>