More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3069 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
174 aa  357  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  71.84 
 
 
174 aa  261  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  67.05 
 
 
178 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  63.16 
 
 
175 aa  234  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  61.99 
 
 
175 aa  226  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  70.06 
 
 
206 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  62.87 
 
 
177 aa  218  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  63.1 
 
 
176 aa  216  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  61.4 
 
 
176 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  66.28 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  61.54 
 
 
173 aa  210  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  58.99 
 
 
179 aa  206  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  61.21 
 
 
181 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  64.46 
 
 
180 aa  202  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  60.24 
 
 
187 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  56.18 
 
 
179 aa  200  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  57.56 
 
 
178 aa  200  7e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  56.9 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  58.14 
 
 
181 aa  197  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  57.56 
 
 
181 aa  197  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  61.4 
 
 
182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  58.89 
 
 
193 aa  195  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  55.76 
 
 
188 aa  194  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  64.12 
 
 
182 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  56.36 
 
 
188 aa  193  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  60.23 
 
 
182 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  60.23 
 
 
176 aa  191  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  60.36 
 
 
176 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  58.72 
 
 
189 aa  186  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  62.05 
 
 
182 aa  184  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  54.55 
 
 
172 aa  184  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  61.54 
 
 
168 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  59.54 
 
 
177 aa  184  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  52.98 
 
 
172 aa  184  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  58.43 
 
 
179 aa  184  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  62.05 
 
 
175 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  62.05 
 
 
175 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  62.05 
 
 
175 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  58.43 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  60.95 
 
 
168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.87 
 
 
201 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  60.36 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  60.36 
 
 
168 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.25 
 
 
378 aa  178  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  61.18 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  56.32 
 
 
178 aa  175  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  58.24 
 
 
173 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  54.82 
 
 
376 aa  176  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  52.1 
 
 
287 aa  175  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  54.05 
 
 
184 aa  174  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  56.89 
 
 
170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  56.55 
 
 
310 aa  171  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  51.5 
 
 
241 aa  171  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  51.52 
 
 
657 aa  170  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.59 
 
 
310 aa  169  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  56.55 
 
 
310 aa  166  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  52.41 
 
 
266 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  57.49 
 
 
177 aa  160  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  58.08 
 
 
172 aa  160  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  57.49 
 
 
228 aa  157  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  51.48 
 
 
372 aa  157  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.6 
 
 
218 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  48.8 
 
 
629 aa  156  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  46.82 
 
 
571 aa  155  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  47.31 
 
 
665 aa  153  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  59.31 
 
 
322 aa  149  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.37 
 
 
164 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  52.41 
 
 
376 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  50.31 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  48.26 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  44.12 
 
 
174 aa  145  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  51.37 
 
 
164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  48.19 
 
 
629 aa  142  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  50.64 
 
 
161 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  50.68 
 
 
164 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  47.59 
 
 
163 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  52.38 
 
 
254 aa  140  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  54.55 
 
 
357 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  44.44 
 
 
223 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75268  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CPR6 (PPIase) (Rotamase)  46.79 
 
 
366 aa  138  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.681927  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  47.65 
 
 
254 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  41.12 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  50.31 
 
 
181 aa  135  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  44.19 
 
 
533 aa  134  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  42.29 
 
 
184 aa  134  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  44.31 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.3 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.2 
 
 
230 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  52.48 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.2 
 
 
230 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  45.76 
 
 
181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  41.07 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18458  predicted protein  50 
 
 
194 aa  127  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0729  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  42.33 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.54 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  48.39 
 
 
372 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1100  Peptidylprolyl isomerase  48.15 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377046  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  55.73 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13387  predicted protein  47.53 
 
 
169 aa  125  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.618265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>