More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0012 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
180 aa  368  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  64.46 
 
 
174 aa  226  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  62.87 
 
 
175 aa  222  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  61.54 
 
 
174 aa  218  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  61.68 
 
 
175 aa  217  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  64.29 
 
 
177 aa  216  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  60.47 
 
 
178 aa  207  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  61.9 
 
 
176 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  60.12 
 
 
176 aa  197  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  54.55 
 
 
188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  55.21 
 
 
188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  56.57 
 
 
179 aa  191  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  56.98 
 
 
173 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  57.23 
 
 
181 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  60.61 
 
 
206 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  55.49 
 
 
176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  57.23 
 
 
187 aa  187  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  63.64 
 
 
182 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  61.31 
 
 
176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  53.33 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  51.98 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  52.78 
 
 
181 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  53.18 
 
 
178 aa  180  8.000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  60.36 
 
 
176 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  60.48 
 
 
182 aa  179  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  59.76 
 
 
176 aa  178  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  52.73 
 
 
172 aa  176  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50 
 
 
201 aa  174  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  59.04 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  59.04 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  59.04 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  52.12 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  58.24 
 
 
182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  64.34 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  64.34 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  53.93 
 
 
193 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  59.64 
 
 
182 aa  168  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  62.24 
 
 
168 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  55.03 
 
 
170 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  50.3 
 
 
266 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  58.43 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  55.69 
 
 
178 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  59.64 
 
 
170 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  62.24 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  48.8 
 
 
657 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  54.8 
 
 
179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  56.8 
 
 
177 aa  160  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  58.58 
 
 
172 aa  160  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  53.67 
 
 
179 aa  160  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.1 
 
 
189 aa  159  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  54.24 
 
 
184 aa  157  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  56.47 
 
 
177 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  48.17 
 
 
241 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  44.97 
 
 
571 aa  154  7e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  48.8 
 
 
665 aa  153  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.55 
 
 
310 aa  150  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  46.29 
 
 
174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  48.78 
 
 
222 aa  148  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  46.67 
 
 
287 aa  148  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.51 
 
 
378 aa  147  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.71 
 
 
376 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.78 
 
 
218 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.85 
 
 
310 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  46.95 
 
 
155 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  45.93 
 
 
178 aa  141  6e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  44.91 
 
 
629 aa  140  8e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.45 
 
 
310 aa  140  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  46.71 
 
 
629 aa  139  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  55.56 
 
 
228 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  50.35 
 
 
376 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  45.91 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  47.02 
 
 
254 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  51.75 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  51.75 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50.68 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  48.55 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  49.31 
 
 
372 aa  131  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  38.19 
 
 
197 aa  131  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  43.03 
 
 
533 aa  130  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  42.86 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.51 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  46.71 
 
 
254 aa  128  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.4 
 
 
195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.95 
 
 
202 aa  127  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  44.19 
 
 
223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  42.26 
 
 
247 aa  125  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000157501  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  48.95 
 
 
163 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75268  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CPR6 (PPIase) (Rotamase)  43.23 
 
 
366 aa  125  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.681927  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1240  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  43.93 
 
 
209 aa  124  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000181585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  44.89 
 
 
181 aa  125  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1025  peptidylprolyl isomerase  44.51 
 
 
209 aa  124  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000366369  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13387  predicted protein  46.15 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.618265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  48.65 
 
 
357 aa  124  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  42.86 
 
 
156 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.44 
 
 
230 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.44 
 
 
230 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00020  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  46.34 
 
 
526 aa  121  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
167 aa  121  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  42.59 
 
 
181 aa  120  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0773  peptidylprolyl isomerase  43.95 
 
 
228 aa  120  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141872  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>