More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0028 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
177 aa  361  4e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  67.43 
 
 
176 aa  244  6e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  68.42 
 
 
178 aa  233  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  71.86 
 
 
182 aa  229  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  62.92 
 
 
181 aa  228  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  62.36 
 
 
181 aa  227  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  65.68 
 
 
173 aa  225  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  67.26 
 
 
175 aa  225  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  67.86 
 
 
182 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  66.48 
 
 
193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  66.67 
 
 
175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  62.87 
 
 
174 aa  218  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  60.23 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  60.23 
 
 
174 aa  216  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  62.5 
 
 
179 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  60.34 
 
 
176 aa  214  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  63.47 
 
 
182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  68.42 
 
 
177 aa  210  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  65.87 
 
 
170 aa  208  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  68.45 
 
 
170 aa  208  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  60.24 
 
 
181 aa  208  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  61.63 
 
 
176 aa  207  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  64.46 
 
 
178 aa  206  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  63.07 
 
 
179 aa  205  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  62.87 
 
 
206 aa  205  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  59.04 
 
 
187 aa  204  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  63.1 
 
 
176 aa  202  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  63.03 
 
 
173 aa  197  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  60.23 
 
 
179 aa  192  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  60.45 
 
 
184 aa  193  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  64.29 
 
 
180 aa  192  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  60.12 
 
 
176 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  56.07 
 
 
178 aa  189  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  62.72 
 
 
176 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  65.48 
 
 
172 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  59.04 
 
 
182 aa  184  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  51.18 
 
 
188 aa  181  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  51.76 
 
 
188 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  54.55 
 
 
177 aa  175  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  51.5 
 
 
287 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  56.65 
 
 
189 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.84 
 
 
201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  52.91 
 
 
657 aa  170  9e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  52.41 
 
 
172 aa  169  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  61.88 
 
 
168 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  61.25 
 
 
168 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  61.25 
 
 
168 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  57.14 
 
 
228 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  50.9 
 
 
241 aa  164  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50 
 
 
378 aa  162  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  51.2 
 
 
172 aa  162  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  59.38 
 
 
168 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.09 
 
 
376 aa  154  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  45.61 
 
 
571 aa  152  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  48.21 
 
 
266 aa  151  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.48 
 
 
310 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  46.51 
 
 
629 aa  150  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  50.61 
 
 
174 aa  150  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.5 
 
 
310 aa  143  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  45.98 
 
 
665 aa  143  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  50.3 
 
 
629 aa  142  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  49.4 
 
 
310 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  48.21 
 
 
357 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.76 
 
 
218 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.42 
 
 
372 aa  140  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.29 
 
 
196 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.36 
 
 
466 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.97 
 
 
468 aa  136  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  47.71 
 
 
254 aa  135  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  48.17 
 
 
178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  46.71 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0773  peptidylprolyl isomerase  43.24 
 
 
228 aa  130  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141872  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.38 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.92 
 
 
195 aa  129  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.66 
 
 
197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  45.2 
 
 
181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  40.2 
 
 
197 aa  127  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  45.61 
 
 
573 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  45.96 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  51.03 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  44.94 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13387  predicted protein  48.17 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.618265 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  51.03 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  53.08 
 
 
223 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0070  peptidylprolyl isomerase  48.52 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.78 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  39 
 
 
197 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  43.71 
 
 
155 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  44.65 
 
 
161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75268  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CPR6 (PPIase) (Rotamase)  45.57 
 
 
366 aa  125  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.681927  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0973  peptidylprolyl isomerase  40.2 
 
 
197 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0954  peptidylprolyl isomerase  40.2 
 
 
197 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.97 
 
 
164 aa  124  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  48.97 
 
 
163 aa  124  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.64 
 
 
322 aa  122  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1524  hypothetical protein  48.47 
 
 
152 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.191079 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  49.67 
 
 
167 aa  122  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>