More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0017 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
187 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  97.24 
 
 
181 aa  358  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  90.29 
 
 
175 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  90.29 
 
 
175 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  90.29 
 
 
175 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  87.28 
 
 
182 aa  297  7e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  79.41 
 
 
173 aa  258  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  80 
 
 
178 aa  253  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  77.84 
 
 
182 aa  249  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  73.71 
 
 
177 aa  239  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  71.01 
 
 
182 aa  227  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  64.12 
 
 
176 aa  218  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  69.28 
 
 
176 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  62.29 
 
 
179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  62.35 
 
 
178 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  70.3 
 
 
170 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  69.09 
 
 
176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  65.87 
 
 
170 aa  210  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  60.8 
 
 
179 aa  208  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  65.29 
 
 
177 aa  206  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  62.65 
 
 
175 aa  204  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  59.04 
 
 
177 aa  204  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  60.24 
 
 
174 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  64.24 
 
 
182 aa  200  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  60.95 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  59.88 
 
 
175 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  59.28 
 
 
174 aa  197  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  61.82 
 
 
206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  57.3 
 
 
181 aa  194  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  56.74 
 
 
181 aa  194  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  62.5 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  60.8 
 
 
184 aa  193  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  55.88 
 
 
172 aa  192  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  63.31 
 
 
172 aa  191  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  56.57 
 
 
178 aa  189  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  60.8 
 
 
179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  56.9 
 
 
176 aa  188  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  55.03 
 
 
172 aa  186  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  59.43 
 
 
193 aa  185  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  53.89 
 
 
188 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  57.23 
 
 
180 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  53.29 
 
 
188 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.43 
 
 
201 aa  170  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  57.14 
 
 
176 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  52.51 
 
 
189 aa  168  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  58.79 
 
 
228 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  52.41 
 
 
287 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.73 
 
 
376 aa  164  8e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  50.6 
 
 
266 aa  160  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  57.34 
 
 
357 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  51.81 
 
 
176 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  48.24 
 
 
571 aa  155  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  56.25 
 
 
310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  57.34 
 
 
310 aa  154  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  47.59 
 
 
241 aa  153  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  54.22 
 
 
168 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  61.36 
 
 
168 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.44 
 
 
196 aa  147  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  51.43 
 
 
179 aa  147  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.19 
 
 
378 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  60.61 
 
 
168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  60.61 
 
 
168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  47.02 
 
 
657 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  54.17 
 
 
310 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.28 
 
 
468 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  47.53 
 
 
174 aa  142  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  48.21 
 
 
372 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  48.24 
 
 
172 aa  141  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  47.09 
 
 
665 aa  141  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  58.04 
 
 
322 aa  135  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  42.35 
 
 
629 aa  134  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  43.53 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  42.93 
 
 
533 aa  131  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.94 
 
 
466 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  49.33 
 
 
254 aa  130  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  46.47 
 
 
197 aa  130  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  47.33 
 
 
376 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  47.65 
 
 
629 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  45.4 
 
 
573 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  51.45 
 
 
161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.9 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  44.91 
 
 
178 aa  127  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  50.33 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  47.1 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  45.45 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.36 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  46.67 
 
 
222 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  51.39 
 
 
164 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  52.82 
 
 
167 aa  125  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  44.85 
 
 
155 aa  123  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  44.58 
 
 
184 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  39.6 
 
 
197 aa  122  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.61 
 
 
164 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  49.06 
 
 
372 aa  122  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  50.69 
 
 
164 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  44.38 
 
 
181 aa  122  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1100  Peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
147 aa  121  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377046  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1025  peptidylprolyl isomerase  43.89 
 
 
209 aa  121  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000366369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.95 
 
 
202 aa  121  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  40.1 
 
 
197 aa  120  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>