More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10708 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
378 aa  769    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.27 
 
 
376 aa  359  4e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  45.45 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  45.43 
 
 
372 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  41.48 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.06 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  40.52 
 
 
310 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.97 
 
 
322 aa  232  9e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  54.55 
 
 
172 aa  182  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  59.31 
 
 
164 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  55.42 
 
 
174 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  55.15 
 
 
172 aa  179  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  53.25 
 
 
174 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  48.29 
 
 
206 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.29 
 
 
201 aa  170  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  54.76 
 
 
176 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
175 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  56.34 
 
 
164 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  53.09 
 
 
188 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  44.93 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  55.63 
 
 
164 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  48.85 
 
 
241 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
177 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  49.41 
 
 
175 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  52.5 
 
 
188 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  48.81 
 
 
287 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  50.62 
 
 
184 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  49.7 
 
 
176 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  39.64 
 
 
573 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  48.48 
 
 
174 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  48.28 
 
 
178 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.88 
 
 
195 aa  153  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  54.29 
 
 
163 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  44.94 
 
 
179 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  46.07 
 
 
179 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  49.4 
 
 
181 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  47.9 
 
 
178 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  48.19 
 
 
187 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  48.72 
 
 
161 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  45.25 
 
 
254 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  46.55 
 
 
176 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  49.12 
 
 
181 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  44.02 
 
 
197 aa  142  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  48.54 
 
 
181 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  47.02 
 
 
173 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  52.38 
 
 
178 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  53.57 
 
 
182 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  53.9 
 
 
168 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  51.45 
 
 
176 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.35 
 
 
195 aa  139  8.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  44.91 
 
 
533 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  46.24 
 
 
178 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  50.6 
 
 
182 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  47.44 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  43.12 
 
 
629 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  45.55 
 
 
193 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  43.75 
 
 
657 aa  135  9e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  46.84 
 
 
222 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  48.68 
 
 
156 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  51.95 
 
 
168 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  50.3 
 
 
170 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  45.16 
 
 
571 aa  134  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  51.28 
 
 
197 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  46.75 
 
 
155 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  51.95 
 
 
168 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  49.71 
 
 
177 aa  133  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  47.75 
 
 
179 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  45.64 
 
 
247 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000157501  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  44.97 
 
 
629 aa  132  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  51.3 
 
 
168 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
170 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  39.51 
 
 
202 aa  132  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1100  Peptidylprolyl isomerase  51.27 
 
 
147 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377046  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  41.99 
 
 
219 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  41.45 
 
 
181 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  47.46 
 
 
176 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.11 
 
 
196 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
228 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04467  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B Precursor (PPIase B)(Rotamase B)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4R3]  43.75 
 
 
214 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.497778  normal  0.168508 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  47.95 
 
 
179 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
182 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7102  predicted protein  49.08 
 
 
164 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0596707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  46.63 
 
 
179 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.29 
 
 
468 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-binding  45.28 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00742073  normal  0.1669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  49.12 
 
 
175 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1460  peptidylprolyl isomerase  49.61 
 
 
166 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0070  peptidylprolyl isomerase  48.95 
 
 
194 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  49.12 
 
 
175 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  50.6 
 
 
182 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  49.12 
 
 
175 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  51.8 
 
 
167 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1485  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  49.04 
 
 
172 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  46.89 
 
 
176 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.38 
 
 
197 aa  126  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  45.58 
 
 
665 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01060  cyclophilin, putative  42.13 
 
 
231 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  44.51 
 
 
180 aa  123  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  45.2 
 
 
181 aa  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>