More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1444 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  100 
 
 
310 aa  635    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  69.9 
 
 
310 aa  449  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  66.67 
 
 
310 aa  434  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  51.78 
 
 
357 aa  296  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.27 
 
 
322 aa  289  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.63 
 
 
372 aa  259  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.82 
 
 
376 aa  253  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.48 
 
 
378 aa  244  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
164 aa  178  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  48.15 
 
 
376 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  58 
 
 
175 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  59.33 
 
 
164 aa  175  9e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  56 
 
 
175 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.65 
 
 
164 aa  169  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  53.59 
 
 
174 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  52.57 
 
 
179 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  61.9 
 
 
197 aa  168  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  55.24 
 
 
174 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  55.76 
 
 
167 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  53.33 
 
 
163 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  52.9 
 
 
178 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  56.25 
 
 
181 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  54.79 
 
 
241 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  56.25 
 
 
187 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  53.74 
 
 
176 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  51.35 
 
 
172 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  51.33 
 
 
287 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  51.35 
 
 
172 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  56.03 
 
 
206 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  52.83 
 
 
178 aa  152  7e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  55.49 
 
 
168 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  55.49 
 
 
168 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  55.49 
 
 
168 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  55.49 
 
 
168 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  51.63 
 
 
176 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  53.47 
 
 
176 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  55.86 
 
 
161 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  49.71 
 
 
181 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  50.9 
 
 
173 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  56.63 
 
 
170 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  48.04 
 
 
179 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  54.55 
 
 
188 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  48.5 
 
 
177 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  53.85 
 
 
188 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  55.76 
 
 
182 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1769  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.69 
 
 
141 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  52.03 
 
 
181 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1396  peptidylprolyl isomerase  51.35 
 
 
141 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.33 
 
 
201 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  51.18 
 
 
182 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  54.19 
 
 
178 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  50.57 
 
 
176 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1485  peptidylprolyl isomerase  51.35 
 
 
141 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  50 
 
 
571 aa  138  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  57.64 
 
 
175 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  57.64 
 
 
175 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  57.64 
 
 
175 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  54.55 
 
 
177 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
176 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  47.37 
 
 
266 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0891  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.02 
 
 
164 aa  136  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  53.85 
 
 
179 aa  135  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  51.88 
 
 
197 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  50.67 
 
 
629 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  50 
 
 
657 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  49.65 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  55.48 
 
 
182 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3544  peptidylprolyl isomerase  54.14 
 
 
163 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0928419  normal  0.154699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  50.3 
 
 
182 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  51.43 
 
 
665 aa  133  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1460  peptidylprolyl isomerase  48.37 
 
 
166 aa  132  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  48.97 
 
 
156 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1467  peptidylprolyl isomerase  54.1 
 
 
203 aa  132  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  52.26 
 
 
193 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  51.3 
 
 
179 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  45.95 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  53.01 
 
 
173 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  44.44 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0729  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.32 
 
 
167 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3720  peptidylprolyl isomerase  54.61 
 
 
163 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.392854  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4201  peptidylprolyl isomerase  56.25 
 
 
171 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.231436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  48.87 
 
 
219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.95 
 
 
189 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1427  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (PPIase B)(rotamase B)  47.02 
 
 
162 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2344  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.7 
 
 
139 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  42.77 
 
 
174 aa  129  7.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  50 
 
 
629 aa  129  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  50.3 
 
 
170 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0331  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  57.41 
 
 
165 aa  129  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592702  normal  0.303367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2354  peptidylprolyl isomerase  59.26 
 
 
174 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  42.86 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000157501  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  52.47 
 
 
172 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-binding  46 
 
 
143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00742073  normal  0.1669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1005  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  50.75 
 
 
155 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000154901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0506  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  47.92 
 
 
179 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0070  peptidylprolyl isomerase  53.24 
 
 
194 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2362  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  55.56 
 
 
143 aa  125  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1082  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.16 
 
 
160 aa  125  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3163  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  57.39 
 
 
140 aa  125  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3178  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  57.66 
 
 
112 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>