More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00130 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  100 
 
 
179 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  82.12 
 
 
179 aa  291  5e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  71.35 
 
 
179 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  75.42 
 
 
179 aa  265  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  66.1 
 
 
173 aa  241  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  68.54 
 
 
184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  67.98 
 
 
177 aa  232  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  63.28 
 
 
181 aa  227  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  60.69 
 
 
178 aa  222  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  60.45 
 
 
181 aa  221  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  60.23 
 
 
177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  59.55 
 
 
176 aa  218  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  63.43 
 
 
181 aa  217  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  61.45 
 
 
175 aa  214  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  65.17 
 
 
182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  65.91 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  62.29 
 
 
187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  57.87 
 
 
178 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  56.98 
 
 
175 aa  203  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  59.78 
 
 
176 aa  201  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  63.13 
 
 
178 aa  201  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  56.18 
 
 
174 aa  200  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  62.57 
 
 
172 aa  201  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  61.36 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  58.99 
 
 
176 aa  198  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  56.83 
 
 
193 aa  197  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  64.57 
 
 
170 aa  197  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  60.57 
 
 
170 aa  197  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  61.27 
 
 
189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  58.29 
 
 
174 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  60.57 
 
 
175 aa  190  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  60.57 
 
 
175 aa  190  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  60.57 
 
 
175 aa  190  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  58.29 
 
 
173 aa  187  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  57.14 
 
 
206 aa  187  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  59.43 
 
 
182 aa  186  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  60.8 
 
 
177 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  53.93 
 
 
176 aa  185  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
176 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  51.41 
 
 
287 aa  174  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  49.72 
 
 
172 aa  174  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  49.72 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  51.7 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  51.41 
 
 
241 aa  168  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.57 
 
 
310 aa  168  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  51.14 
 
 
188 aa  168  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  48.04 
 
 
176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  48.62 
 
 
266 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  51.98 
 
 
180 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  53.14 
 
 
168 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.09 
 
 
201 aa  155  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  52.57 
 
 
168 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  52.57 
 
 
168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  54.29 
 
 
228 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  53.71 
 
 
168 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.07 
 
 
378 aa  150  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.89 
 
 
376 aa  150  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  46.74 
 
 
657 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  49.37 
 
 
310 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  44.94 
 
 
571 aa  144  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50.97 
 
 
310 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  43.26 
 
 
629 aa  141  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.71 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  41.99 
 
 
174 aa  130  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  47.34 
 
 
372 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  43.5 
 
 
357 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  44.39 
 
 
179 aa  127  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  49.04 
 
 
164 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  44.94 
 
 
629 aa  127  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  48.73 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  43.82 
 
 
163 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  48.59 
 
 
223 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  41.34 
 
 
665 aa  125  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  42.11 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  41.67 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  46.02 
 
 
167 aa  121  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.7 
 
 
164 aa  120  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50.32 
 
 
322 aa  120  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1100  Peptidylprolyl isomerase  47.73 
 
 
147 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377046  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.77 
 
 
230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.77 
 
 
230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.21 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02320  conserved hypothetical protein  40.36 
 
 
491 aa  117  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  40.11 
 
 
160 aa  117  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1082  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.57 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  40.98 
 
 
573 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  41.81 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1427  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (PPIase B)(rotamase B)  41.52 
 
 
162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  45.45 
 
 
376 aa  115  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1396  peptidylprolyl isomerase  42.37 
 
 
141 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.25 
 
 
196 aa  114  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13387  predicted protein  46.71 
 
 
169 aa  111  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.618265 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.71 
 
 
466 aa  110  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7102  predicted protein  43.27 
 
 
164 aa  110  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0596707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  42.31 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  40.11 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  37.2 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0891  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.95 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  43.36 
 
 
254 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.02 
 
 
468 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>