40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1362 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1362  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
82 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.172157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1356  helix-turn-helix domain-containing protein  82.54 
 
 
321 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00217094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  40 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38.18 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
229 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 
262 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
262 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  32.43 
 
 
262 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  37.04 
 
 
262 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  35.29 
 
 
194 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2047  transcriptional regulator, XRE family  52.27 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  41.51 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  32.69 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  33.96 
 
 
197 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  35.29 
 
 
196 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 
304 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 
490 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  33.33 
 
 
259 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  44.9 
 
 
347 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  43.4 
 
 
489 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  0.0000852105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
291 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  40.38 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  39.29 
 
 
209 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  40.38 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 
185 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
198 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>